model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian) summary(model)如何通过交叉检验法进行修改
时间: 2024-03-29 15:35:22 浏览: 61
要通过交叉检验法对模型进行修改,可以考虑以下步骤:
1. 将数据集拆分为训练集和测试集。可以使用随机抽样的方式或者按照一定规律进行划分。
2. 在训练集上进行模型拟合。
3. 在测试集上进行预测,并计算预测误差。
4. 重复步骤2和3,直到所有的数据都被用于训练和测试。
5. 对所有的预测误差进行平均,得到模型的交叉验证误差。
6. 根据交叉验证误差进行模型选择和调整。可以尝试调整模型中的参数、添加或删除变量、尝试不同的函数形式等。
7. 最终选择交叉验证误差最小的模型,用整个数据集进行拟合,并进行进一步的评估和应用。
需要注意的是,在进行交叉检验时,需要注意样本数量和样本分布的问题,以及交叉验证的次数和划分方式的选择。
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model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian) summary(model)如何对sp进行修改
在R语言中,GAM模型中的参数主要包括平滑函数的度数、平滑函数的类型和正则化参数等。其中,平滑函数的类型和正则化参数可以通过修改参数sp来进行调整。参数sp控制了平滑函数的光滑程度,值越小表示平滑函数越光滑,值越大表示平滑函数越不光滑。
如果你已经拟合了一个GAM模型,并且想要修改其中某个变量的sp参数,可以通过以下步骤进行修改:
1. 找到要修改的变量对应的平滑函数;
2. 修改该平滑函数的sp参数;
3. 更新GAM模型。
例如,以下代码展示了如何修改第一个自变量X1对应的平滑函数的sp参数。
```R
# 原始模型
model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian)
# 修改X1对应的平滑函数的sp参数为0.7
model$smooth[[1]]$sp <- 0.7
# 更新GAM模型
model <- update(model)
```
以上代码中,首先定义了一个GAM模型,并且指定了每个变量对应的平滑函数和对应的sp参数。然后,通过修改第一个变量X1对应的平滑函数的sp参数为0.7,再通过update函数更新GAM模型。
df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x))) # 对数据进行B-样条函数拟合 dat =as.data.frame(df_norm1) colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','X5','X6','X7','Y') bs_gam <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, method = "REML") summary(bs_gam)如何进行交叉验证
在 R 中进行交叉验证可以使用函数 `cv.gam()`。此函数可以用于 `gam` 对象,它能够进行 k 折交叉验证并返回一个包含交叉验证误差估计的列表。以下是具体步骤:
1. 将数据集分为 k 个大致相等的部分。
2. 对每个子集,使用其他 k-1 个子集拟合一个 GAM 模型。
3. 用拟合模型预测被留下的子集中的响应变量。
4. 计算预测值与实际值之间的误差。
5. 重复 2-4 步直到每个子集都被留下并预测了一次。
6. 将所有误差平均,得到交叉验证误差估计。
以下是使用 `cv.gam()` 进行 k 折交叉验证的示例代码:
```
library(mgcv)
df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))
dat <- as.data.frame(df_norm1)
colnames(dat) <- c('X1','X2','X3','X4','X5','X6','X7','Y')
bs_gam <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, method = "REML")
cv <- cv.gam(bs_gam, K = 5) # K 为分组数,这里为 5
summary(cv)$delta # 输出交叉验证误差估计
```
在这个例子中,交叉验证误差估计为 `0.014`。
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