通过csv权重矩阵创建netdrawx的graph的方法
时间: 2024-05-15 07:16:59 浏览: 82
1. 首先,将csv权重矩阵导入到Python环境中。
2. 接着,使用Pandas库读取csv文件,将权重矩阵转换成矩阵形式。
3. 使用NetworkX库创建一个空的有向图对象。
4. 遍历矩阵中的每一个元素,如果元素的值大于0,则将对应的节点添加到图中,并添加一条有向边。
5. 使用NetDrawX库将图可视化,并设置节点的大小、颜色等属性。
6. 对图进行布局,可以使用Spring布局、Circle布局等方法。
7. 最后,保存可视化结果。
示例代码如下:
```python
import pandas as pd
import networkx as nx
import netdrawx as ndx
# 读取csv文件,转成矩阵形式
df = pd.read_csv('weight_matrix.csv', index_col=0)
matrix = df.values
# 创建空有向图
G = nx.DiGraph()
# 遍历权重矩阵,添加节点和边
for i in range(len(matrix)):
for j in range(len(matrix[i])):
if matrix[i][j] > 0:
G.add_node(i)
G.add_node(j)
G.add_edge(i, j, weight=matrix[i][j])
# 可视化图
fig = ndx.create_netdrawx()
ndx.draw_networkx_nodes(G, fig)
ndx.draw_networkx_edges(G, fig)
ndx.set_node_attributes(G, fig, 'size', 10)
ndx.set_node_attributes(G, fig, 'color', 'red')
ndx.spring_layout(G, fig)
ndx.save_fig(fig, 'graph.png')
```
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