p + annotate("segment", x = 5, xend = 10, y = anno_df$y[1], yend = anno_df$y[1], data = anno_df, subset = group == "A") + annotate("segment", x = 5, xend = 10, y = anno_df$y[2], yend = anno_df$y[2], data = anno_df, subset = group == "B")
时间: 2023-06-19 08:09:20 浏览: 99
这段代码使用了ggplot2包中的annotate函数,用于在图形中添加注释线段。其中,第一个annotate函数添加了一个起点坐标为(5, anno_df$y[1]),终点坐标为(10, anno_df$y[1])的线段,它的数据来源是anno_df数据框,对数据框进行了子集筛选,只用了group列为"A"的数据。第二个annotate函数同理,只不过线段的终点坐标变为了(anno_df$y[2], anno_df$y[2]),对应的数据子集为group列为"B"的数据。
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a <- cor.test(as.numeric(IP_ASR_SDI$ASR),as.numeric(IP_ASR_SDI$SDI),method = "pearson") > ggplot(IP_ASR_SDI,aes(SDI,ASR)) + geom_point(aes(color = location, shape = location))+ + annotate('text',x=0.3,y=max(IP_ASR_SDI$ASR),#定义添加文本位置 + size=4,color='black') + + label=paste('P = ',round(a[["p.value"]],3),sep = ''), Error: unexpected ',' in: " size=4,color='black') + label=paste('P = ',round(a[["p.value"]],3),sep = '')," >
在你的代码中,有一个语法错误。在`annotate()`函数的最后一行,你将逗号放在了文本标签参数之后。逗号应该放在参数之间,而不是在参数之后。以下是修正后的代码:
```R
a <- cor.test(as.numeric(IP_ASR_SDI$ASR), as.numeric(IP_ASR_SDI$SDI), method = "pearson")
ggplot(IP_ASR_SDI, aes(SDI, ASR)) +
geom_point(aes(color = location, shape = location)) +
annotate('text', x = 0.3, y = max(IP_ASR_SDI$ASR), # 定义添加文本位置
size = 4, color = 'black',
label = paste('P = ', round(a[["p.value"]], 3), sep = ''))
```
这样,代码应该能够正确运行并在散点图上添加带有相关性检验结果的文本标签。
ggplot(IP_ASR_SDI,aes(SDI,ASR)) + geom_point(aes(color = location, shape = location))+ scale_shape_manual(values = 1:4) + annotate('text',x=0.3,y=max(IP_ASR_SDI$ASR),#定义添加文本位置 label=paste('R = ',round(a[["estimate"]],3),sep = ''), size=4,color='black') + annotate('text',x=0.3,y=max(IP_ASR_SDI$ASR),#定义添加文本位置 label=paste('P = ',round(a[["p.value"]],3),sep = ''), size=4,color='black') + geom_smooth(colour='black',stat="smooth",method='loess',se=F,span=0.5
这段代码使用了`scale_shape_manual()`函数将散点的形状设置为1到4的连续整数序列。接下来,通过`annotate()`函数添加了两个文本标签,分别用于显示相关系数(R)和p值(P)。最后,使用`geom_smooth()`函数添加了一条黑色的LOESS平滑曲线。
整个代码的功能如下:
1. 创建一个散点图,横轴为SDI,纵轴为ASR。
2. 使用`color = location, shape = location`设置散点的颜色和形状,其中形状和颜色根据`location`变量进行分组。
3. 使用`scale_shape_manual(values = 1:4)`手动设置散点的形状为1到4的连续整数序列。
4. 使用`annotate()`函数添加两个文本标签,分别显示相关系数(R)和p值(P)。
5. 使用`geom_smooth()`函数添加一条黑色的LOESS平滑曲线。
请注意,由于在这段代码中没有提到相关系数(R)和p值(P)的计算过程,所以你可能需要在之前的代码中进行相关计算,并将结果保存在`a`对象中,然后再使用`annotate()`函数来添加相应的文本标签。
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