Error: unexpected symbol in "metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id !=TCGA-44-3917-01B"
时间: 2024-05-07 21:19:23 浏览: 18
这个错误通常是因为在代码中使用了无效的符号。在这种情况下,是因为“-”符号没有被正确地引用。请尝试将“-”符号改为下划线“_”或使用引号将其括起来,例如:
```
metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id != "TCGA-44-3917-01B"]
```
或者
```
metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id != TCGA_44_3917_01B]
```
相关问题
Error: unexpected symbol in: "cox_model <- coxph(Surv(T, E) ~ original:firstorder:RobustMeanAbsoluteDeviation + log-sigma-4-0-mm-3D"
这个错误是因为变量名中含有特殊字符(如'-'),需要使用反引号(`)将变量名括起来,以避免 R 解释器将其识别为语法错误。
以下是修正后的代码:
```R
library(survival)
# 基于数据集df构建COX模型
cox_model <- coxph(Surv(T, E) ~ `original:firstorder:RobustMeanAbsoluteDeviation` +
`log-sigma-4-0-mm-3D:firstorder:InterquartileRange` +
`log-sigma-5-0-mm-3D:glszm:SmallAreaEmphasis` +
`wavelet-LLH:firstorder:InterquartileRange` +
`wavelet-LLH:firstorder:Uniformity` +
`wavelet-HHL:firstorder:Mean` +
`wavelet-HHH:firstorder:Mean` +
`wavelet-LLL:glcm:Autocorrelation` +
`wavelet-LLL:glcm:ClusterProminence`, data = df)
# 输出COX模型的摘要信息
summary(cox_model)
```
请注意,变量名使用反引号括起来是一种处理含有特殊字符的变量名的通用方法,可以在其他情况下使用。
Error: unexpected symbol in "add_zongjia_column <- function(data) { zongjia <- data[["shuliang"]] * data[["hsje"]] data"
这个错误提示表明在函数定义中有一个意外的符号,可能是少了或多了一些引号、括号等等。在这种情况下,我们需要检查函数定义的语法是否正确。
在这个特定的函数定义中,我们可以看到以下错误:
```
zongjia <- data[["shuliang"]] * data[["hsje"]]
```
这里的问题在于`[[`操作符内部的引号没有被正确地转义。在R中,双引号通常用于表示字符串,因此如果我们想在字符串中包含一个双引号,我们需要使用`\`进行转义。因此,正确的函数定义应该是:
```
add_zongjia_column <- function(data) {
zongjia <- data[["shuliang"]] * data[["hsje"]]
data$zongjia <- zongjia
return(data)
}
```
请注意,这里的`[[`操作符内部的引号已经正确地转义了,因此函数定义中再次出现了这个错误的概率较小。