在R中，想要做出不同分组在门水平上的物种相对丰度堆叠条形图，要怎么做

可以使用ggplot2包和reshape2包来绘制物种相对丰度堆叠条形图。

首先，需要将数据框转换为长格式，即每个样本和物种的相对丰度都在一列中。可以使用reshape2包中的melt函数进行转换。

然后，使用ggplot2包中的geom_bar函数绘制堆叠条形图，设置fill参数为物种名称，设置position参数为"stack"来堆叠不同物种的相对丰度。

最后，使用facet_wrap函数根据分组变量将图形分为多个子图。

下面是一个示例代码：

library(ggplot2)
library(reshape2)

# 读入数据
data <- read.table("data.txt", header=TRUE)

# 将数据转换为长格式
data_long <- melt(data, id.vars=c("Group", "Sample"), variable.name="Species", value.name="Abundance")

# 绘制堆叠条形图
ggplot(data_long, aes(x=Sample, y=Abundance, fill=Species)) +
  geom_bar(stat="identity", position="stack") +
  facet_wrap(~Group, ncol=2) +
  labs(x="Sample", y="Relative Abundance")