使用compute ps all stress/atom后,如何用dump将其结果输出
时间: 2024-10-14 19:17:28 浏览: 83
使用opengl 4.3的compute shader实现通用计算
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当你在分子动力学模拟(如LAMMPS)中使用`compute ps all stress/atom`命令计算每个原子的压力贡献之后,你可以通过`dump`命令将这个信息保存到文件中。这里是一个基本步骤:
1. 首先,你需要设置一个`dump`变量,指定输出的信息类型、频率(每多少步执行一次)、以及文件名。例如:
```
dump dumpid custom 10000 rank none id type x y z pression/atom
```
这里`dumpid`是你给新创建的dump块命名,`custom`表示自定义输出,`10000`指每10000步输出一次,`rank none`表示所有处理器上都输出,`id type x y z`是常规原子坐标信息,而`pression/atom`则是你想输出的压力贡献。
2. 接下来,在`run`命令后面加上`style ave/time`来平均每一段时间内的压力值,如果需要的话,可以进一步过滤或排序输出的数据。
```
run 1000000
```
3. 最后,当模拟结束后,你可以通过访问指定的文件(通常是`.dumps/dumpid.dump`)查看压力分布数据。注意,你需要结合脚本语言(如Python的LammpsIO库)来解析这个二进制文件,以便将其转换成人类可读的形式。
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