shell dos2unix

时间: 2023-11-01 22:58:00 浏览: 63
在Ubuntu下,你可以使用apt-get命令来安装dos2unix工具。dos2unix命令是用于将文本文件从DOS格式转换为Unix格式的工具。它可以帮助你解决在不同操作系统上编辑文件时可能遇到的换行符问题。 如果你想保持文件的时间戳不变,可以使用"-k"参数。下面是一些使用dos2unix命令的示例: 1. dos2unix -k file:将单个文件转换为Unix格式并保持时间戳不变。 2. dos2unix -k file1 file2 file3:将多个文件转换为Unix格式并保持时间戳不变。 3. dos2unix -k -o file1 file2 file3:将多个文件转换为Unix格式并保持时间戳不变,输出到指定的文件。 4. dos2unix -k -n oldfile newfile:将单个文件从DOS格式转换为Unix格式并保持时间戳不变,输出到新文件。 还有其他一些选项和参数可以用于定制dos2unix命令的行为,你可以使用"dos2unix --help"命令查看完整的选项列表。 总结: - 使用apt-get命令在Ubuntu下安装dos2unix工具。 - dos2unix命令用于将文本文件从DOS格式转换为Unix格式。 - 使用"-k"参数可以保持文件时间戳不变。 - dos2unix命令还有其他选项和参数可以使用,可以使用"dos2unix --help"命令查看完整的选项列表。
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dos2unix 替换成windows

dos2unix命令是用于将文本文件从DOS格式转换为UNIX格式的命令。如果你想将UNIX格式的文本文件转换为DOS格式,你可以使用unix2dos命令。下面是一个使用dos2unix命令将UNIX格式的文件转换为DOS格式的示例[^1]: ```shell dos2unix file.txt ``` 这将把file.txt文件从UNIX格式转换为DOS格式。如果你想批量替换一个目录下的所有文件,你可以使用find和xargs命令结合dos2unix命令[^2]: ```shell sudo find /path/to/directory -type f -exec dos2unix {} \; ``` 这将在指定的目录下找到所有文件,并使用dos2unix命令将它们转换为DOS格式。

dos2unix *

dos2unix *命令可以将当前目录下所有文件的换行符从Windows格式转换为Unix/Linux格式。具体操作步骤如下: ```shell # 1. 进入需要转换的目录 cd /path/to/directory # 2. 执行dos2unix命令 dos2unix * ``` 执行完上述命令后,当前目录下所有文件的换行符都会被转换为Unix/Linux格式。

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解释以下shell代码每行的意义echo "××××××欢迎使用字符串匹配系统×××××" while : do echo " ××××××××××××××××××" echo " × 请选择功能" × echo " × 0.检查程序功能"× echo " × 1.字符串匹配" × echo " × 2.排 序" × echo " × 3.查 找" × echo " × 4.数据可视化" × echo " × 5.退 出" × echo " ××××××××××××××××××" read -rsN1 number case $number in 0) sudo apt-get install bowtie2 sudo apt-get install dos2unix sudo apt-get install samtools ;; 1) dos2unix ref.fa dos2unix reads1.fq bowtie2-build ref.fa ref bowtie2 -x ref -U reads1.fq -S result1.sam echo "匹配完成" echo "匹配结果存入result1.sam" ;; 2) declare -a y1 declare -a y2 declare -a y3 y1=(awk '{print $1}' result1.sam) y2=(awk '{print $4}' result1.sam) y3=(awk '{print $10}' result1.sam) length=0 length=${#y1[@]} for((i=0;i<length;i++));do { echo "${y1[i+3]} ${y2[i+1]} ${y3[i]}">>result1.txt } done sort -n -k 2 -t " " result1.txt>>result2.txt #将result.txt以第二列排序,输出存储到result2.txt grep -v ' 0 ' result2.txt >> result3.txt #排除匹配结果为0的结果并保存在result3.txt里 echo "排序完成!结果已经放在result3.txt里面" ;; 3)echo "请输入查找的左/右边界" read l1 r1 cat result1.txt | awk '{if($2>='$l1'&&$2<='$r1'){print $0>"result.txt"}}' echo "查找结果已经放在了resuyt.txt文件里。" ;; 4) echo "数据可视化" samtools view -bS result1.sam > result1.bam #sam文件转换为bam格式 samtools sort result1.bam result1.sort #对bam文件进行排序 samtools index result1.sorted.bam #创建bai索引 samtools tview result1.sort.bam ref.fa #可视化界面展示 ;; 5)echo "你已安全退出,欢迎下次使用!" exit 0 ;; esac done

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