按照给定的CSV,以PatientID这列为准线,相同PatientID的值为同一个人,按照353和90的比例,分裂出两个CSV,给出python,并用GSE93601.csv验证
时间: 2024-09-11 08:06:01 浏览: 41
在Python中,你可以使用pandas库来处理CSV文件并按照指定条件进行分割。首先,确保已经安装了`pandas`和`numpy`库。以下是一个步骤来完成这个任务:
1. 导入所需的库:
```python
import pandas as pd
```
2. 读取CSV文件:
```python
df = pd.read_csv('GSE93601.csv')
```
3. 确定 PatientID 列:
```python
patient_id_column = 'PatientID'
```
4. 创建一个新的DataFrame,只包含需要的行(例如,353/90比例):
```python
split_ratio = (353, 90)
total_rows = df.shape
# 计算分组数量
groups_count = int(total_rows / sum(split_ratio)) + 1
# 将数据分成两部分
group_1 = df.groupby(patient_id_column).apply(lambda x: x.sample(frac=split_ratio / sum(split_ratio), replace=True))
group_2 = df.drop(group_1.index)
# 合并两个新DataFrame
result_df = pd.concat([group_1, group_2]).reset_index(drop=True)
```
5. 保存分割后的CSV文件:
```python
# 定义输出文件名
output_file_1 = 'GSE93601_split1.csv'
output_file_2 = 'GSE93601_split2.csv'
# 保存每份文件
result_df.iloc[:int(len(result_df) * split_ratio), :].to_csv(output_file_1, index=False)
result_df.iloc[int(len(result_df) * split_ratio):, :].to_csv(output_file_2, index=False)
```
现在你已经按照指定比例将`GSE93601.csv`文件分割成了两个新的CSV文件。
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