按照给定的CSV,以PatientID这列为准线,相同PatientID的值为同一个人,按照80%(约等于708)和20%(约等于178)的比例,分裂出两个CSV,给出python,并用GSE93601.csv验证
时间: 2024-09-11 10:06:02 浏览: 69
用类图表达概化和特化-对象数据库系统
在Python中,我们可以使用pandas库来处理CSV文件并按指定条件分割数据。首先确保已经安装了pandas,如果还没有,可以通过pip安装:
```bash
pip install pandas
```
以下是一个步骤化的代码示例,用于按照`PatientID`列将数据分割成两部分,大约按照80%和20%的比例:
```python
import pandas as pd
# 加载CSV文件
df = pd.read_csv('GSE93601.csv')
# 确保'PatientID'列存在
assert 'PatientID' in df.columns, "PatientID column not found."
# 按照PatientID分组,计算每个ID的行数
grouped = df.groupby('PatientID').size().reset_index(name='count')
# 计算分割点
split_point_80 = grouped['count'].quantile(0.8)
split_point_20 = grouped['count'].quantile(0.9) # 使用更接近80%的数值避免误差
# 分割数据
large_df = df[df.groupby('PatientID')['count'].transform('sum') >= split_point_80]
small_df = df[df.groupby('PatientID')['count'].transform('sum') < split_point_20]
# 保存结果到新的CSV文件
large_df.to_csv('GSE93601_large.csv', index=False)
small_df.to_csv('GSE93601_small.csv', index=False)
```
这段代码首先读取CSV文件,然后根据`PatientID`分组统计每个性别出现的次数。接着,它计算了80%和20%的分割点。`large_df`包含`PatientID`在原始数据集中出现次数大于或等于80%的记录,而`small_df`则包含小于这个阈值的记录。最后,我们将这两部分分别保存到新的CSV文件。
阅读全文