path=paste0
时间: 2024-05-30 07:16:53 浏览: 10
("https://www.example.com/", "page1.html")
This code creates a URL path by concatenating "https://www.example.com/" and "page1.html" using the paste0 function. The resulting path is "https://www.example.com/page1.html".
相关问题
setwd("D:\\生信\\TCGAload") #数据路径 > library("rjson") > json <- jsonlite::fromJSON("metadata.cart.2023-07-14.json") #metadata文件名 > View(json) > sample_id <- sapply(json$associated_entities,function(x){x[,1]}) > file_sample <- data.frame(sample_id,file_name=json$file_name) > count_file <- list.files('gdc_download_20230714_155413.592273',pattern = '*.tsv',recursive = TRUE) #Counts文件夹名 > count_file_name <- strsplit(count_file,split='/') > count_file_name <- sapply(count_file_name,function(x){x[2]}) > #下面的修改基因数 > matrix = data.frame(matrix(nrow=60660,ncol=0)) > #下面的修改样本例数 > for (i in 1:44){ + path = paste0('gdc_download_20230714_155413.592273',count_file[i]) #Counts文件夹名 + data<- read.delim(path,fill = TRUE,header = FALSE,row.names = 1) + colnames(data)<-data[2,] + data <-data[-c(1:6),] + data <- data[3] #数据类型,选择其中之一 3:unstranded;4:stranded_first;5:stranded_second;6:tpm_unstranded;7:fpkm_unstranded;8:fpkm_uq_unstranded + colnames(data) <- file_sample$sample_id[which(file_sample$file_name==count_file_name[i])] + matrix <- cbind(matrix,data) + } Error in file(file, "rt") : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(file, "rt") : cannot open file 'gdc_download_20230714_155413.59227303953c9c-8b2b-4e61-bf59-ae75e67fe845/be87079d-9aba-406d-881b-c09077e837db.rna_seq.augmented_star_gene_counts.tsv': No such file or directory >
根据您提供的代码,您遇到了文件找不到的错误。错误信息显示无法打开文件 'gdc_download_20230714_155413.59227303953c9c-8b2b-4e61-bf59-ae75e67fe845/be87079d-9aba-406d-881b-c09077e837db.rna_seq.augmented_star_gene_counts.tsv',该文件似乎不存在。
请确保在运行该代码之前,您已经正确设置了工作目录并指定了正确的文件路径。还要确保此文件实际存在于指定的位置。
另外,请注意在读取文件时使用正确的文件路径和文件名。您可以通过在命令提示符下运行 `list.files('gdc_download_20230714_155413.592273', pattern = '*.tsv', recursive = TRUE)` 来检查文件是否存在。这将列出匹配模式 '*.tsv' 的所有文件。
如果问题仍然存在,请提供更多关于文件路径和结构的详细信息,以便我能够更好地帮助您解决问题。
r语言fread(paste0
引用: 在初学C语言文件操作的过程中,有时会遇到fread()和fwrite()函数的返回值始终为0的情况,即使文件的读写操作正常进行。这是因为...
引用: 在R语言中,使用fread()函数时需要注意使用正确的文件路径和编码方式。例如,可以使用read_csv()函数来导入纯文本文件,并通过指定locale参数来设置编码方式,使用col_types参数来指定要读取的数据类型。
引用: 在R语言中,可以使用text()函数来在坐标区域内添加文字,而mtext()函数可以在边空处添加文字。例如,可以使用lm()函数进行线性回归,并使用text()函数在图表中添加相关的文字说明。
问题: 请告诉我,如何在R语言中使用fread()函数来读取文件的路径和编码方式?
在R语言中,使用fread()函数来读取文件的路径和编码方式可以通过paste0()函数来实现。可以使用paste0()函数将文件路径和编码方式拼接成一个字符串作为fread()函数的参数。例如,可以使用以下代码来读取文件路径为"path_to_file",编码方式为"GBK"的文件:
fread(paste0("path_to_file", ", locale = locale(encoding = 'GBK')"))<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* [为什么fread(),fwrite()的返回值总是为0,但是读写文件正常](https://download.csdn.net/download/lj_70596/13697255)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
- *2* *3* [[R语言]手把手教你如何绘图(万字)](https://blog.csdn.net/qq_63511424/article/details/128309587)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
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