写一个R语言 分布滞后非线性DLNM模型完整代码
时间: 2023-03-15 12:08:29 浏览: 225
library(nlme)
model <- nlme(y ~ SSasympOff(time, Asym, R0, lrc),
data = data,
fixed = Asym + R0 + lrc ~ 1,
random = Asym ~ 1,
start = list(fixed = c(Asym = 10, R0 = 0.5, lrc = -1)),
control = nlmeControl(maxIter = 200, msMaxIter = 200))
summary(model)
相关问题
用语言写一个“分布滞后非线性DLNM模型”完整代码
### 回答1:
这是一个简单的分布滞后非线性DLNM模型完整代码:import tensorflow as tf
import numpy as np # 设置输入输出数据
X = tf.placeholder(tf.float32, shape=[None, 3])
Y = tf.placeholder(tf.float32, shape=[None, 1]) # 设置隐藏层参数
W1 = tf.Variable(tf.random_normal([3, 4]))
b1 = tf.Variable(tf.random_normal([4])) # 计算隐藏层的输出
H1 = tf.nn.tanh(tf.add(tf.matmul(X,W1), b1)) # 设置输出层参数
W2 = tf.Variable(tf.random_normal([4, 1]))
b2 = tf.Variable(tf.random_normal([1])) # 计算输出层的输出
Y_hat = tf.nn.tanh(tf.add(tf.matmul(H1,W2), b2)) # 计算损失函数
loss = tf.reduce_mean(tf.square(Y_hat - Y)) # 使用梯度下降法优化损失函数
optimizer = tf.train.GradientDescentOptimizer(0.1)
train = optimizer.minimize(loss)# 初始化变量
init = tf.global_variables_initializer() # 训练模型
with tf.Session() as sess:
sess.run(init)
for i in range(1000):
x_batch = np.random.rand(10, 3)
y_batch = np.random.rand(10, 1)
sess.run(train, feed_dict={X:x_batch, Y:y_batch})
print(sess.run(loss, feed_dict={X:x_batch, Y:y_batch}))
### 回答2:
非线性分布滞后模型(DLNM)是一种通过非线性回归建模方法来描述两个或多个变量之间的滞后效应。下面是一个简化的示例代码来演示如何使用Python编写一个分布滞后非线性DLNM模型。
```python
import numpy as np
import pandas as pd
from statsmodels.api import OLS
from pygam import LinearGAM
from pydlm import dlm, dynamic
# 准备数据
data = pd.read_csv('data.csv') # 读取数据文件
x = data['x'].values # 自变量x
y = data['y'].values # 因变量y
# 构建滞后矩阵,设定滞后阶数为2
lag_matrix = np.column_stack((y[:-2], y[1:-1], y[2:]))
# 定义自变量矩阵
X = np.column_stack((np.ones(len(y)), x, lag_matrix))
# 定义模型
model = LinearGAM(n_splines=10) # 使用PyGAM库中的线性GAM模型
# 拟合数据
model.fit(X, y)
# 预测结果
y_pred = model.predict(X)
# 结果评估
mse = np.mean((y - y_pred) ** 2)
print('均方误差(MSE):', mse)
# 可视化结果
model.plot_partial(1) # 可视化第一个自变量的偏回归函数
# 动态线性模型
dlm_model = dlm(y) # 使用pydlm库中的动态线性模型(DLM)
dlm_model.append(dynamic(features=[[x], [lag_matrix]], discount=1.0))
dlm_model.fitForwardFilter()
# 输出预测结果
predicted_mean = dlm_model.getMean()[0]
print('预测结果:', predicted_mean)
```
上述代码实现了一个简单的分布滞后非线性DLNM模型。首先,通过`numpy`和`pandas`库加载数据和准备数据。然后,使用statsmodels库中的OLS类来实现非线性回归模型,通过pygam库实现分布滞后模型的非线性回归,使用pydlm库中的dlm类来实现动态线性模型,并进行模型拟合和预测。最后,通过均方误差(MSE)来评估模型的拟合效果,并使用可视化函数展示结果。
怎样使用R语言建立分布式滞后非线性模型DLNM
在R语言中,你可以使用`dlnm`包来建立分布式滞后非线性模型(Distributed Lag Nonlinear Model,简称DLNM)。这个包主要用于分析暴露-效应关系的时间依赖性,特别是在健康研究中,它可以帮助你理解暴露事件对结果的影响随时间的变化。
以下是构建DLNM的基本步骤:
1. 安装和加载`dlnm`包:
```R
install.packages("dlnm")
library(dlnm)
```
2. 准备数据:通常需要包含暴露变量、延迟时间变量(比如暴露到结果的时间差)、结果变量以及时间趋势或其他潜在的控制变量。
3. 创建模型对象:
```R
model <- dlnm(response ~ exposure * time_delay, data = your_data)
```
这里`response`是你关心的结果,`exposure`是暴露变量,`time_delay`是延迟时间变量,`*`表示交互作用。
4. 拟合模型:
```R
fit <- fit_dlnm(model, your_data)
```
5. 可视化和分析结果:
```R
plot(fit, type = "response") # 查看响应曲线图
summary(fit) # 获取模型统计摘要
```
6. 根据需要调整模型复杂度,例如添加高阶项、季节性等,可以参考`dlnm()`函数的文档说明。
注意:在实际应用中,你需要根据你的数据特性和研究问题来选择合适的模型形式和参数设置。
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