for(i in row.names(data)){ + test=wilcox.test(data[i,] ~ Type) + pvalue=test$p.value + Sig=ifelse(pvalue<0.001,"***",ifelse(pvalue<0.01,"**",ifelse(pvalue<0.05,"*",""))) + if(pvalue<0.05){ + sigVec=c(sigVec, paste0(i, Sig)) + sigGeneVec=c(sigGeneVec, i)} + } Error in model.frame.default(formula = data[i, ] ~ Type) : 参数'data[i, ]'的种类(list)不对

这个错误的原因是在wilcox.test函数的公式中，参数data应该是一个数据框或矩阵，而不是一个单一的向量。在这里，data[i,]返回的是一个长度为1的列表，而不是一个数据框或矩阵。为了解决这个问题，你可以将data转换为数据框或矩阵，并使用适当的列和行来进行子集选择。例如，你可以使用以下代码：

for(i in row.names(data)){
  test=wilcox.test(as.matrix(data[,i]) ~ Type)
  pvalue=test$p.value
  Sig=ifelse(pvalue<0.001,"***",ifelse(pvalue<0.01,"**",ifelse(pvalue<0.05,"*","")))
  if(pvalue<0.05){
    sigVec=c(sigVec, paste0(i, Sig))
    sigGeneVec=c(sigGeneVec, i)}
}

在这个例子中，as.matrix()函数将data转换为矩阵，并使用[,i]来选择第i行。