setwd("/Users/15878/Desktop/") data<-read_excel("huizhi.xlsx") b<-ggplot(data,aes(x=Beta(DL)/Beta(IM),y=GMV-Precuneus)) b+geom_point(size=2,color='blue')+ coord_fixed()+theme_classic()+ geom_smooth(method = "lm",formula = y ~ x,size=2,color="black",fill="green")+ theme (aspect.ratio=1,axis.text.x = element_text (size = 15),axis.title.x = element_text (size = 15),axis.title.y = element_text(size = 15),axis.text.y = element_text (size = 15))+ stat_cor(data=data, method = "pearson") ggsave("KRd.png",dpi=300,limitsize = FALSE,width=10,height=10,units="cm")解释代码
时间: 2023-11-14 10:06:11 浏览: 77
这段代码使用了 ggplot2 包来绘制散点图。首先,通过 `setwd()` 函数设置工作目录,然后使用 `read_excel()` 函数读取名为 "huizhi.xlsx" 的 Excel 文件中的数据。接下来,创建了一个 `ggplot()` 对象 `b`,并使用 `aes()` 函数指定了 x 轴和 y 轴的变量。通过 `geom_point()` 函数添加散点图层,并指定点的大小和颜色。使用 `coord_fixed()` 函数使 x 轴和 y 轴的比例相等。使用 `theme_classic()` 函数设置图表主题风格,使用 `geom_smooth()` 函数添加一条拟合直线层,指定了拟合方法为线性回归,并设置线的大小、颜色和填充颜色。使用 `theme()` 函数设置图表的主题元素,例如坐标轴标签和刻度标签的字体大小等。最后,使用 `stat_cor()` 函数添加了一个相关系数文本框,并使用 `ggsave()` 函数将图表保存为名为 "KRd.png" 的 PNG 文件,并指定了分辨率、大小和单位等参数。
相关问题
library(xlsx) setwd("D:/R") # 读取数据 data1 <- read.xlsx("试验.xlsx",sheetName = "man") data2 <- read.xlsx("试验.xlsx",sheetName = "weman") data3 <- read.xlsx("试验.xlsx",sheetName = "all") B <- data1$男孩 F <- data3$父亲 G <- data2$女孩 M <- data3$母亲 # t检验 t1=(mean(B)-mean(F))/(sd(B)/sqrt(length(B))) t1 p1 <- pt(t1,length(B)-1) p1 if (p1>0.05){ print("男生高于父亲") } else{ print("男生不高于父亲") } #检验结果为t=-5.123508,显著性P值=1.488898e-06>0.05,接受原假设,认为男生不高于父亲 t2=(mean(G)-mean(M))/(sd(G)/sqrt(length(G))) t2 p2 <- pt(t2,length(G)-1) p2 if (p2>0.05){ print("女生高于母亲") } else{ print("女生不高于母亲") } #检验结果为t=3.994843,显著性P值=0.9999377>0.05,接受原假设,认为女生高于母亲 # 计算结果 results <- list() # 中亲 - 子女 x <- data3$学生 y <- data3$中亲 lm.model <- lm(x ~ y, data = data3) model_summary <- summary(lm.model) model_coeffs <- coef(lm.model) standard_error <- model_summary$sigma CI <- confint(lm.model) cor_coef <- cor(x, y) p_value <- model_summary$coefficients[2,4] results[["中亲-子女"]] <- data.frame(coefficients = model_coeffs, std_error = standard_error, conf_int = CI, cor_coef = cor_coef, p_value = p_value) 方法分析
这段代码是一个用于统计学分析的R语言代码。主要包括以下几个方面的内容:
1. 读取数据:使用xlsx包中的read.xlsx函数读取名为“试验.xlsx”的Excel文件中的三个表格数据。
2. t检验:计算男孩身高和父亲身高的t检验值和P值,以及女孩身高和母亲身高的t检验值和P值,并根据P值判断身高是否有显著差异。
3. 线性回归:使用lm函数对数据进行线性回归分析,计算中亲与子女的相关系数、回归系数、标准误差、置信区间和P值,并将结果存储在名为results的列表中。
这些方法可以用于探索数据之间的关系和差异,帮助做出决策和推断。
#读取2.22_output_firststept.csv文件 getwd() setwd("/Analysis_B/20220326_JNILI/010_summary") data <- read.csv("output_summary12.csv", header = F) getwd() setwd("/home/Reference_database/new_taxdump") read.table("fullnamelineage.dmp", header = F, sep = '\t', fill = TRUE,stringsAsFactors=FALSE, quote = "") A <- read.table("fullnamelineage.dmp", header = F, sep = '\t', fill = TRUE,stringsAsFactors=FALSE, quote = "") [c(1,3,5)] B <- read.table("host.dmp", header = F, sep ='|') M1 <- merge(data,B,by='saccver_N',all.X=TRUE) M2 <- merge(M1,A,by='saccver_N',all.X=TRUE) write.csv(M2, file = "/Analysis_B/20220326_JNILI/010_summary/output_summary13.csv",row.names = T)这段代码什么意思
这段代码的主要作用是将两个数据文件进行合并,最后将合并后的数据写入一个新的csv文件中。具体实现过程如下:
1. 使用getwd函数获取当前的工作目录,然后使用setwd函数将工作目录更改为/Analysis_B/20220326_JNILI/010_summary/,并读取名为output_summary12.csv的csv文件到data数据框中。
2. 使用getwd函数获取当前的工作目录,然后使用setwd函数将工作目录更改为/home/Reference_database/new_taxdump/,并读取名为fullnamelineage.dmp的文本文件到A数据框中,同时只保留数据框中第1、3、5列的数据。
3. 使用read.table函数读取名为host.dmp的文本文件到B数据框中,文件中的列之间以"|"分隔。
4. 使用merge函数将data数据框和B数据框按“saccver_N”列进行合并,合并后的结果保存到数据框M1中,all.X=TRUE表示使用左连接方式,即只保留data数据框中的数据。
5. 使用merge函数将M1数据框和A数据框按“saccver_N”列进行合并,合并后的结果保存到数据框M2中,all.X=TRUE表示使用左连接方式,即只保留M1数据框中的数据。
6. 使用write.csv函数将合并后的数据框M2写入到/Analysis_B/20220326_JNILI/010_summary/output_summary13.csv文件中,row.names=T表示将行名写入文件中。
综上,这段代码主要的目的是将三个数据文件进行合并,并将合并后的数据写入一个新的csv文件中,方便后续的数据分析和处理。
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