jupyter Notebook中应用虚拟环境中rdkit的版本

在Jupyter Notebook中应用虚拟环境中rdkit的版本，可以按照以下步骤进行操作：

1. 创建虚拟环境并安装rdkit

在终端中进入项目目录，使用conda或者virtualenv创建虚拟环境，并在虚拟环境中安装rdkit。例如，使用conda创建名为myenv的虚拟环境并安装rdkit：

conda create -n myenv python=3.7
conda activate myenv
conda install -c conda-forge rdkit

2. 将虚拟环境添加到Jupyter Notebook中

使用ipykernel将虚拟环境添加到Jupyter Notebook中，以便在Notebook中使用虚拟环境中安装的rdkit。在虚拟环境中运行以下命令：

pip install ipykernel
python -m ipykernel install --user --name myenv --display-name "Python (myenv)"

其中，--name参数指定虚拟环境的名称，--display-name参数指定在Notebook中显示的名称。

3. 在Jupyter Notebook中使用虚拟环境中的rdkit

在Jupyter Notebook中打开一个Notebook文件，并选择“Python (myenv)”内核。在Notebook中导入rdkit并使用它的功能，例如：

from rdkit import Chem
mol = Chem.MolFromSmiles('CCO')
print(mol.GetNumAtoms())

这个例子中，首先导入rdkit的Chem模块，然后使用MolFromSmiles函数将SMILES字符串转化为分子对象，并使用GetNumAtoms函数计算分子中原子的数量。