请写出使用fsl的 bet2命令，批量处理文件夹中几十个文件且包含参数设置的完整命令的shell脚本，并将结果输出到一个新的文件夹中

以下是一个使用fsl的bet2命令的shell脚本，可以在Linux或Mac终端中使用：

#!/bin/bash

# 设置输入和输出文件夹路径
input_dir="/path/to/input/folder"
output_dir="/path/to/output/folder"

# 设置bet2参数
fractional_intensity=0.5
vertical_gradient=0
radius=0

# 循环处理每个文件
for file in "$input_dir"/*
do
  # 提取文件名和扩展名
  filename=$(basename "$file")
  extension="${filename##*.}"
  filename="${filename%.*}"
  
  # 使用bet2命令处理文件并将结果保存到输出文件夹中
  bet2 "$file" "$output_dir/$filename"_brain -f $fractional_intensity -g $vertical_gradient -r $radius
done

在上面的脚本中，我们首先设置了输入和输出文件夹的路径，然后设置了bet2命令的参数。这些参数包括：

- fractional_intensity：用于控制脑组织与非脑组织之间的阈值，取值范围为0到1，默认为0.5。
- vertical_gradient：用于控制图像中的梯度，可以在更加复杂的图像中提高分割效果，取值范围为0到1，默认为0。
- radius：用于控制平滑的程度，取值范围为0到10，默认为0。

接下来，我们使用一个循环来处理输入文件夹中的每个文件。我们首先提取文件的名称和扩展名，然后使用bet2命令处理文件并将结果保存到输出文件夹中。输出文件的名称是原始文件名称和“_brain”一起构成的，例如“image.nii.gz”将变为“image_brain.nii.gz”。

使用该脚本时，只需将输入和输出文件夹的路径更改为实际的路径，然后保存为一个.sh文件并在终端中运行。输出文件夹中将包含与输入文件夹中的每个文件对应的处理后的文件。