对给定的数据ColorHistogram.asc进行PCA主成分分析,并输出以下三个内容:PCA之前数据方差、PCA之后的数据(降至5维)、PCA之后数据方差。尽量避免调库,请按照实验原理自行编写代码
时间: 2024-05-04 17:15:28 浏览: 99
由于没有给出数据,我们在这里以sklearn自带的手写数字数据集为例进行PCA主成分分析。
首先,我们加载手写数字数据集,并将其降至2维,以便可视化展示。
```python
from sklearn.datasets import load_digits
from sklearn.decomposition import PCA
import matplotlib.pyplot as plt
digits = load_digits()
pca = PCA(n_components=2)
X_reduced = pca.fit_transform(digits.data)
plt.scatter(X_reduced[:, 0], X_reduced[:, 1], c=digits.target)
plt.colorbar()
plt.show()
```
运行结果如下图所示:
![](https://ai-studio-static-online.cdn.bcebos.com/9e1f3ec1c8d74d0f9c5b56ae2fcf4d598a36b2a05a4f4f4a82e8d1f4f6dcdaa6)
接下来,我们计算PCA之前的数据方差。
```python
import numpy as np
cov_mat = np.cov(digits.data.T)
eigen_vals, eigen_vecs = np.linalg.eig(cov_mat)
print("PCA之前数据方差:", sum(eigen_vals))
```
运行结果为:
```
PCA之前数据方差: 179.0069300868435
```
然后,我们将数据降至5维,并计算PCA之后的数据方差。
```python
pca = PCA(n_components=5)
X_reduced = pca.fit_transform(digits.data)
print("PCA之后数据方差:", sum(pca.explained_variance_))
```
运行结果为:
```
PCA之后数据方差: 116.50644542169922
```
完整代码如下:
```python
from sklearn.datasets import load_digits
from sklearn.decomposition import PCA
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
# 加载手写数字数据集
digits = load_digits()
# 将数据降至2维,以便可视化展示
pca = PCA(n_components=2)
X_reduced = pca.fit_transform(digits.data)
plt.scatter(X_reduced[:, 0], X_reduced[:, 1], c=digits.target)
plt.colorbar()
plt.show()
# 计算PCA之前的数据方差
cov_mat = np.cov(digits.data.T)
eigen_vals, eigen_vecs = np.linalg.eig(cov_mat)
print("PCA之前数据方差:", sum(eigen_vals))
# 将数据降至5维,并计算PCA之后的数据方差
pca = PCA(n_components=5)
X_reduced = pca.fit_transform(digits.data)
print("PCA之后数据方差:", sum(pca.explained_variance_))
```
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