ECD鉴别修饰如何计算
时间: 2024-01-15 15:04:10 浏览: 28
ECD(Electron Capture Dissociation)是一种质谱技术,可以用来鉴别肽段中的修饰。在ECD质谱分析中,肽段经过电子俘获作用后发生解离,产生多个碎片离子,这些碎片离子的质荷比可以用来确定修饰的位置和类型。
具体而言,ECD质谱分析中,修饰会影响肽段的碎片离子的相对丰度,从而可以通过比较修饰前后肽段的碎片离子质荷比的相对丰度差异来确定修饰的类型和位置。一般来说,修饰会导致肽段的碎片离子相对丰度的变化,因此可以通过比较碎片离子的相对丰度来确定修饰的类型和位置。
需要注意的是,ECD质谱分析是一种高级的技术,需要专业的人员进行分析和解读。同时,ECD质谱分析的结果也需要与其他实验数据进行综合分析,以确定修饰的类型和位置。
相关问题
c620 ecd换算
C620 ECD是一种测量电导率的仪器,用于测量溶液中的电导率。电导率是指溶液中离子的传导能力,通常用于评估溶液的浓度和纯度。
换算C620 ECD的过程主要涉及两个方面:电导率和温度。
1. 电导率换算:
C620 ECD通常以毫西门子/厘米(mS/cm)为单位测量电导率。如果你有其他单位的电导率值,可以使用以下换算公式:
毫西门子/厘米(mS/cm) = 毫秒/厘米(mS/cm) * 10
2. 温度换算:
C620 ECD测量电导率时通常需要考虑温度对电导率的影响。因此,在换算时需要将测量值校正到标准温度下(通常为25摄氏度)。具体的温度校正公式可以根据C620 ECD的使用说明或者设备提供的校正表进行计算。
希望以上信息对你有所帮助!
能生成一道这样的计算题吗
当然可以,以下是一道示例题目:
假设有一段肽段序列为"AFGKEDLMNQ",通过质谱分析发现其分子量为1324.6 Da,但由于其可能存在磷酸化修饰,因此需要进一步鉴定。经过ECD质谱分析后,得到如下的碎片离子的相对丰度:
离子类型 | 质荷比 | 相对丰度
---|---|---
b1 | 222.1 | 0.1
b2 | 338.2 | 0.3
b3 | 425.3 | 0.5
y1 | 238.1 | 0.2
y2 | 355.2 | 0.4
y3 | 541.4 | 0.6
请问,该肽段是否存在磷酸化修饰?如果存在,确定其修饰的位置。
提示:该肽段的未修饰分子量为1157.5 Da。
解答:
首先需要计算该肽段的未修饰分子量,即去除磷酸化修饰后的分子量。根据氨基酸的分子量,可以得到该肽段的未修饰分子量为:
A:71.04, F:147.07, G:57.02, K:128.09, E:129.12, D:115.09, L:113.08, M:131.04, N:114.04, Q:128.06
未修饰肽段分子量 = 71.04 + 147.07 + 57.02 + 128.09 + 129.12 + 115.09 + 113.08 + 131.04 + 114.04 + 128.06 = 1157.5 Da
由于分子量为1324.6 Da,因此存在一个分子量增加了167.1 Da的修饰。接下来通过比较碎片离子的相对丰度来确定修饰的位置。
首先需要计算每个离子的质量,然后计算修饰前后的质量差。具体计算如下:
离子类型 | 质荷比 | 质量 | 修饰前质量 | 修饰后质量 | 质量差
---|---|---|---|---|---
b1 | 222.1 | 221.1 | 936.5 | 1103.6 | 167.1
b2 | 338.2 | 337.2 | 1094.4 | 1261.5 | 167.1
b3 | 425.3 | 424.3 | 1157.5 | 1324.6 | 167.1
y1 | 238.1 | 1086.5-238.1=848.4 | 309.1 | 476.2 | 167.1
y2 | 355.2 | 1086.5-355.2=731.3 | 493.3 | 660.4 | 167.1
y3 | 541.4 | 1086.5-541.4=545.1 | 779.5 | 946.6 | 167.1
根据上表可以发现,在b1、b2、b3、y1、y2、y3离子中,碎片离子的质量差均为167.1 Da,与肽段的分子量增加一致。因此,可以确定该肽段存在磷酸化修饰。同时,由于在b1、b2、b3离子中,修饰的质量差与肽段末端的K氨基酸的质量差一致,因此可以确定该肽段的第四个氨基酸K被磷酸化修饰。