centroids = random.sample(dataSet, k) kmeans算法中这代码啥意思

时间: 2024-04-07 07:31:04 浏览: 24
这段代码是 K-Means 算法中用来随机初始化簇质心的代码。K-Means 算法是一种聚类算法,它通过不断地迭代更新簇质心的位置,将数据集中的点分配到不同的簇中。在算法开始时,需要随机选择 K 个点作为初始的簇质心,这里的代码就是从数据集中随机选择 K 个点作为簇质心。其中,dataSet 是数据集,k 是要聚类的簇数。函数 random.sample(seq, k) 是 Python 中用来从序列 seq 中随机选择 k 个元素的函数。
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Traceback (most recent call last): File "/home/zhaojing/pt_cluster/main.py", line 69, in <module> centroids, cluster = kmeans(dataset, 2) File "/home/zhaojing/pt_cluster/main.py", line 40, in kmeans centroids = random.sample(dataSet, k) File "/home/zhaojing/anaconda3/envs/zhaojing/lib/python3.8/random.py", line 359, in sample raise TypeError("Population must be a sequence or set. For dicts, use list(d).") TypeError: Population must be a sequence or set. For dicts, use list(d). 这个报错是什么意思

这个报错意思是数据集 `dataSet` 不是一个序列或集合,而是一个字典类型的数据,而在 `random.sample` 函数中,只能对序列或集合进行抽样,不能对字典类型的数据进行抽样。 解决这个问题的方法是将数据集 `dataSet` 转换为一个序列或集合,比如将其转换为列表类型。可以在调用 `random.sample` 函数之前,先将数据集转换为列表类型,如下所示: ```python centroids = random.sample(list(dataSet), k) ``` 这样就可以解决这个报错问题了。

kmeans = KMeans(n_clusters=self.m) x0 = [i for i in np.zeros(self.n)] kmeans.fit([x0]) centroids = kmeans.cluster_centers_.flatten()出现n_samples=1 should be >= n_clusters=3.怎么修正

这个错误提示表明簇的数量`n_clusters`大于样本数量`n_samples`,因此需要增加样本数量或者减少簇的数量。通常情况下,聚类算法需要至少有和簇心数量相等的样本才能进行聚类,否则算法无法收敛。 在这里,可以考虑增加样本数量,或者减少簇的数量。由于样本数量是1,因此可以尝试将簇的数量减少到1,即将`self.m`的值设为1。修正后的代码如下所示: ``` kmeans = KMeans(n_clusters=1) x0 = [i for i in np.zeros(self.n)] kmeans.fit([x0]) centroids = kmeans.cluster_centers_.flatten() ``` 如果需要增加样本数量,可以考虑使用更多的样本数据进行聚类。

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代码改进:import numpy as np import pandas as pd import matplotlib as mpl import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.datasets import make_blobs def distEclud(arrA,arrB): #欧氏距离 d = arrA - arrB dist = np.sum(np.power(d,2),axis=1) #差的平方的和 return dist def randCent(dataSet,k): #寻找质心 n = dataSet.shape[1] #列数 data_min = dataSet.min() data_max = dataSet.max() #生成k行n列处于data_min到data_max的质心 data_cent = np.random.uniform(data_min,data_max,(k,n)) return data_cent def kMeans(dataSet,k,distMeans = distEclud, createCent = randCent): x,y = make_blobs(centers=100)#生成k质心的数据 x = pd.DataFrame(x) m,n = dataSet.shape centroids = createCent(dataSet,k) #初始化质心,k即为初始化质心的总个数 clusterAssment = np.zeros((m,3)) #初始化容器 clusterAssment[:,0] = np.inf #第一列设置为无穷大 clusterAssment[:,1:3] = -1 #第二列放本次迭代点的簇编号,第三列存放上次迭代点的簇编号 result_set = pd.concat([pd.DataFrame(dataSet), pd.DataFrame(clusterAssment)],axis = 1,ignore_index = True) #将数据进行拼接,横向拼接,即将该容器放在数据集后面 clusterChanged = True while clusterChanged: clusterChanged = False for i in range(m): dist = distMeans(dataSet.iloc[i,:n].values,centroids) #计算点到质心的距离(即每个值到质心的差的平方和) result_set.iloc[i,n] = dist.min() #放入距离的最小值 result_set.iloc[i,n+1] = np.where(dist == dist.min())[0] #放入距离最小值的质心标号 clusterChanged = not (result_set.iloc[:,-1] == result_set.iloc[:,-2]).all() if clusterChanged: cent_df = result_set.groupby(n+1).mean() #按照当前迭代的数据集的分类,进行计算每一类中各个属性的平均值 centroids = cent_df.iloc[:,:n].values #当前质心 result_set.iloc[:,-1] = result_set.iloc[:,-2] #本次质心放到最后一列里 return centroids, result_set x = np.random.randint(0,100,size=100) y = np.random.randint(0,100,size=100) randintnum=pd.concat([pd.DataFrame(x), pd.DataFrame(y)],axis = 1,ignore_index = True) #randintnum_test, randintnum_test = kMeans(randintnum,3) #plt.scatter(randintnum_test.iloc[:,0],randintnum_test.iloc[:,1],c=randintnum_test.iloc[:,-1]) #result_test,cent_test = kMeans(data, 4) cent_test,result_test = kMeans(randintnum, 3) plt.scatter(result_test.iloc[:,0],result_test.iloc[:,1],c=result_test.iloc[:,-1]) plt.scatter(cent_test[:,0],cent_test[:,1],color = 'red',marker = 'x',s=100)

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