ANNOVAR 根据CHR_ID CHR_POS 怎么注释、

ANNOVAR可以根据CHR_ID和CHR_POS来进行注释。具体步骤如下：

1. 准备输入文件：将需要注释的变异信息按照以下格式保存在一个文本文件中：CHR_ID CHR_POS REF ALT。其中，CHR_ID表示染色体编号，CHR_POS表示变异位置，REF表示参考序列，ALT表示替换的序列。

2. 下载参考基因组文件和注释数据库文件：ANNOVAR需要参考基因组文件和注释数据库文件来进行注释。可以从ANNOVAR官网下载最新的参考基因组文件和注释数据库文件。

3. 运行ANNOVAR：在命令行中输入以下命令来运行ANNOVAR：

./annotate_variation.pl -downdb -buildver hg19 -webfrom annovar refGene humandb/

这个命令会下载并安装hg19版本的参考基因组文件和refGene注释数据库文件。

4. 注释变异信息：在命令行中输入以下命令来注释变异信息：

./annotate_variation.pl -out output_file -buildver hg19 input_file humandb/

其中，output_file是输出文件名，input_file是输入文件名，humandb/是注释数据库文件所在目录。

5. 查看注释结果：可以在输出文件中查看注释结果，包括变异类型、基因名称、转录本信息等。