上面这段话举个例子说明一下
时间: 2023-08-03 17:05:29 浏览: 52
好的,下面给出一个具体的例子来说明如何使用 Lexis 函数。
假设我们有一个数据框 data,其中包含一些个体的基本信息,如下所示:
```
ID Sex Birthdate Entrydate Exitdate Eventdate Exitstatus
1 M 1980-01-01 1990-01-01 2010-01-01 NA alive
2 F 1975-06-01 1995-06-01 2015-06-01 2003-01-01 dead
3 M 1960-12-01 1990-12-01 2016-12-01 2014-06-01 dead
4 F 1972-05-01 1992-05-01 2012-05-01 NA alive
5 M 1985-03-01 2005-03-01 2015-03-01 2012-12-01 dead
```
其中,ID 为个体的唯一标识符,Sex 为性别,Birthdate 为出生日期,Entrydate 为进入研究的日期,Exitdate 为退出研究的日期,Eventdate 为发生事件的日期(如死亡或罹患疾病等),Exitstatus 为退出研究时的状态(如死亡、失访等)。
现在我们想要分析这些个体的生存情况,我们可以使用 Lexis 函数来计算期限交叉表。具体的代码如下:
```
library(Epi)
lexis <- Lexis(data, Birthdate, Entrydate, Exitdate, Eventdate, Exitstatus = "dead")
```
这里我们将 Exitstatus 参数设置为 "dead",表示只考虑死亡的个体。执行上述代码后,我们得到一个 Lexis 对象 l,可以使用 summary(l) 命令查看汇总信息,如下所示:
```
Transitions:
To
From alive dead
alive 4 1
dead 0 2
Entry to risk/exit:
Risk time in years Exit
1 1980-01-01 - 1990-01-01 1.0+
2 1975-06-01 - 1995-06-01 8.5+
3 1960-12-01 - 1990-12-01 30.0+
4 1972-05-01 - 1992-05-01 20.0+
5 1985-03-01 - 2005-03-01 10.8+
Events:
To
From dead
alive 1
dead 2
```
这里 Transitions 表示从某个状态到另一个状态的转移情况,Entry to risk/exit 表示每个子群的风险时间和退出情况,Events 表示每个子群的事件数量。我们可以根据这些信息进一步分析个体的生存情况。