blastn按照相似度98%和覆盖度80%去除相似的核酸序列，命令举例 。

Blastn是一种用于寻找核酸序列之间相似性的工具，它通常用于比较DNA或RNA序列。如果你想要使用blastn来去除基于相似度98%和覆盖度80%的重复序列，你需要设置合适的参数。在NCBI的Command Line Blast+工具中，这可以通过`-outfmt`选项和自定义的格式字符串来完成，同时使用`-max_target_seqs`控制返回的最大相似序列数。

例如，一个基本的blastn命令可能会像这样：

blastn -query your_sequence.fasta -db reference_database.fasta \
        -outfmt "6 std sscs" \
        -max_target_seqs 1 \
        -perc_identity 98.0 \
        -coverage 80.0

这里解释一下各个参数：
- `-query`: 查询序列文件
- `-db`: 对比数据库
- `outfmt 6`: 输出格式，包括标题信息、得分、E值等，以及SSC（Sequence Spanning Clusters）模式，有助于处理高相似度的序列
- `-max_target_seqs 1`: 只保留一个最相似的匹配
- `-perc_identity 98.0`: 设置识别的最低同源性百分比为98%
- `-coverage 80.0`: 设置最低覆盖度为80%

请注意，实际操作前可能需要根据你的具体需求调整参数，并且确保你的输入数据格式正确。