局部保持投影算法python
时间: 2024-01-11 10:22:43 浏览: 110
局部保留投影(Locality Preserving Projection, LPP)算法是一种用于降维的线性方法。它通过保持样本之间的局部关系来实现降维,即在降维后的低维空间中,相邻样本之间的距离应该尽可能地保持不变。
以下是一个使用Python实现局部保留投影算法的示例:
```python
import numpy as np
from sklearn.neighbors import NearestNeighbors
def LPP(X, n_components):
# 计算样本之间的距离矩阵
nn = NearestNeighbors(n_neighbors=k)
nn.fit(X)
distances, indices = nn.kneighbors(X)
# 构建权重矩阵
W = np.zeros((len(X), len(X)))
for i in range(len(X)):
Xi = X[indices[i]]
Xi_mean = np.mean(Xi, axis=0)
Xi_centered = Xi - Xi_mean
Si = np.dot(Xi_centered.T, Xi_centered)
Si_inv = np.linalg.pinv(Si)
for j in range(k):
W[i, indices[i, j]] = np.dot(Xi_centered[j], np.dot(Si_inv, Xi_centered[j]))
# 计算归一化的权重矩阵
D = np.diag(np.sum(W, axis=1))
L = D - W
L_norm = np.dot(np.dot(np.sqrt(np.linalg.inv(D)), L), np.sqrt(np.linalg.inv(D)))
# 计算特征值和特征向量
eigenvalues, eigenvectors = np.linalg.eig(L_norm)
indices = np.argsort(eigenvalues)[:n_components]
eigenvectors = eigenvectors[:, indices]
# 返回降维后的数据
return np.dot(X, eigenvectors)
# 示例用法
X = np.array([[1 2, 3], [4, 5, 6],7, 8, 9]])
n_components = 2
k = 2
X_lpp = LPP(X, n_components)
print(X_lpp)
```
这个示例中,我们使用了`sklearn.neighbors.NearestNeighbors`来计算样本之间的距离矩阵,并根据距离矩阵构建了权重矩阵。然后,我们通过计算归一化的权重矩阵的特征值和特征向量,得到了降维后的数据。
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