局部保留投影算法LPP,python代码
时间: 2023-06-10 08:06:37 浏览: 269
局部保持投影算法LPP
局部保留投影算法(Locality Preserving Projection,LPP)是一种非常常用的降维算法。下面是使用Python实现LPP算法的代码示例:
```python
import numpy as np
from sklearn.neighbors import kneighbors_graph
class LPP:
def __init__(self, n_components=2, n_neighbors=5):
self.n_components = n_components
self.n_neighbors = n_neighbors
def fit_transform(self, X):
N = X.shape[0]
W = kneighbors_graph(X, self.n_neighbors, mode='connectivity').toarray()
D = np.diag(W.sum(axis=1))
L = D - W
D_inv_sqrt = np.diag(1 / np.sqrt(D.diagonal()))
M = D_inv_sqrt @ L @ D_inv_sqrt
eigvals, eigvecs = np.linalg.eigh(M)
eigvecs = eigvecs[:, np.argsort(eigvals)[:self.n_components]]
return eigvecs
```
在上述代码中,我们使用了`sklearn.neighbors`库中的`kneighbors_graph`函数来计算数据集中的k近邻图,然后根据该图计算出拉普拉斯矩阵L。接下来,我们计算D的平方根的逆阵以及M,然后计算出M的特征向量,并将其按照对应的特征值从小到大进行排序。最后,我们将排序后的前n个特征向量作为数据的新特征表示。
使用LPP算法的示例代码如下:
```python
from sklearn.datasets import make_swiss_roll
import matplotlib.pyplot as plt
X, _ = make_swiss_roll(n_samples=1000, noise=0.2, random_state=42)
lpp = LPP(n_components=2, n_neighbors=10)
X_transformed = lpp.fit_transform(X)
plt.scatter(X_transformed[:, 0], X_transformed[:, 1])
plt.show()
```
在上述示例代码中,我们使用`make_swiss_roll`函数生成一个三维数据集,然后使用LPP算法将其降到二维,并将结果可视化。
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