kmeans tsne聚类

时间: 2023-10-03 20:00:26 浏览: 91
K-means和t-SNE都是常用的聚类算法。 K-means是一种迭代聚类算法,通过计算数据点与聚类中心之间的距离来确定数据点的簇归属。首先,随机选择K个初始聚类中心;然后,将数据点分配给离其最近的聚类中心;接着,更新聚类中心位置为所属簇内所有数据点的平均值;最后,重复前两个步骤,直到聚类中心不再变化或达到指定的迭代次数。K-means算法的优点是简单、高效,对处理大规模数据集较为合适。但是,其结果受到初始聚类中心的选择和对聚类数量K的设定敏感。 t-SNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)是一种非线性降维算法,通过在高维空间中保留数据点间的相似性关系,将数据映射到低维空间。在t-SNE中,首先计算数据点之间的相似性,并使用概率分布表示;然后,通过最小化高维空间和低维空间之间的差异,得到低维空间中数据点的位置。相比于传统的线性降维算法(如PCA),t-SNE能更好地保留数据点的局部结构。然而,t-SNE的计算复杂度较高,且难以解释低维空间中数据点的具体含义。 K-means和t-SNE在聚类问题中可以结合使用。K-means可以对数据进行初始聚类,然后使用t-SNE将数据映射到低维空间进行可视化。在低维空间中,可以更直观地观察数据点的聚类情况,并进行进一步的分析和解释。这种结合使用的方法可以更好地理解和解释数据聚类的结果。
相关问题

如何对比dbscan与kmeans聚类结果好坏

对比 DBSCAN 和 KMeans 的聚类结果好坏,可以使用同一种评价指标来进行对比。以下是一个计算轮廓系数来对比两种聚类算法结果好坏的示例代码: ```python import numpy as np import pandas as pd from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.cluster import KMeans, DBSCAN from sklearn.metrics import silhouette_score # 读取csv文件 data = pd.read_csv('data.csv', header=0) # 提取数据 X = data.iloc[:, :60].values # 使用TSNE进行降维,降到2维 tsne = TSNE(n_components=2) X_tsne = tsne.fit_transform(X) # 使用KMeans进行聚类 kmeans = KMeans(n_clusters=5) kmeans.fit(X_tsne) # 使用DBSCAN进行聚类 dbscan = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=5) dbscan.fit(X_tsne) # 计算轮廓系数 kmeans_score = silhouette_score(X_tsne, kmeans.labels_, metric='euclidean') dbscan_score = silhouette_score(X_tsne, dbscan.labels_, metric='euclidean') print('KMeans 轮廓系数为:', kmeans_score) print('DBSCAN 轮廓系数为:', dbscan_score) ``` 在上述代码中,计算轮廓系数分别对 KMeans 和 DBSCAN 的聚类结果进行了评价,并输出了两种算法的轮廓系数。可以通过比较两种算法的轮廓系数来判断两种算法的聚类结果好坏,值越大表示聚类结果越好。需要注意的是,轮廓系数只是评价聚类结果的一种指标,不一定适用于所有聚类算法和数据集,因此需要根据具体情况进行选择和综合考虑。

kmeans结合tsne

K-means算法通常用于聚类分析,而t-SNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)是一种降维算法,用于将高维数据映射到二维或三维空间进行可视化。结合K-means和t-SNE可以在聚类分析中进行数据可视化。 首先,使用K-means算法对数据进行聚类。K-means算法根据数据的特征将其分为预定义的多个簇。这些簇由聚类中心点和与之相关联的数据点组成。 然后,将K-means算法得到的聚类结果作为输入,使用t-SNE算法进行降维和可视化。t-SNE通过保留数据间的局部结构关系,将高维数据映射到低维空间。在这个低维空间中,数据点的相对位置更能反映它们之间的相似性。 最后,通过绘制t-SNE降维后的数据点,并根据K-means聚类结果对它们进行着色,可以直观地展示聚类结果。这样做有助于理解数据集的内在结构,并观察不同聚类之间的关系。 总体而言,结合K-means和t-SNE可以同时进行聚类和可视化,帮助我们更好地理解数据。
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修改下面代码,另画一张可视化图展示出t_sne里面的数据每15行数据个用一种颜色画出。 import pandas as pd from sklearn import cluster from sklearn import metrics import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.decomposition import PCA def k_means(data_set, output_file, png_file, t_labels, score_file, set_name): model = cluster.KMeans(n_clusters=7, max_iter=1000, init="k-means++") model.fit(data_set) # print(list(model.labels_)) p_labels = list(model.labels_) r = pd.concat([data_set, pd.Series(model.labels_, index=data_set.index)], axis=1) r.columns = list(data_set.columns) + [u'聚类类别'] print(r) # r.to_excel(output_file) with open(score_file, "a") as sf: sf.write("By k-means, the f-m_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.fowlkes_mallows_score(t_labels, p_labels))+"\n") sf.write("By k-means, the rand_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.adjusted_rand_score(t_labels, p_labels))+"\n") '''pca = PCA(n_components=2) pca.fit(data_set) pca_result = pca.transform(data_set) t_sne = pd.DataFrame(pca_result, index=data_set.index)''' t_sne = TSNE() t_sne.fit(data_set) t_sne = pd.DataFrame(t_sne.embedding_, index=data_set.index) plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 0] plt.plot(dd[0], dd[1], 'r.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 1] plt.plot(dd[0], dd[1], 'go') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 2] plt.plot(dd[0], dd[1], 'b*') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 3] plt.plot(dd[0], dd[1], 'o') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 4] plt.plot(dd[0], dd[1], 'm.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 5] plt.plot(dd[0], dd[1], 'co') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 6] plt.plot(dd[0], dd[1], 'y*') plt.savefig(png_file) plt.clf() '''plt.scatter(data_set.iloc[:, 0], data_set.iloc[:, 1], c=model.labels_) plt.savefig(png_file) plt.clf()''' frog_data = pd.read_csv("D:/PyCharmPython/pythonProject/mfcc3.csv") tLabel = [] for family in frog_data['name']: if family == "A": tLabel.append(0) elif family == "B": tLabel.append(1) elif family == "C": tLabel.append(2) elif family == "D": tLabel.append(3) elif family == "E": tLabel.append(4) elif family == "F": tLabel.append(5) elif family == "G": tLabel.append(6) scoreFile = "D:/PyCharmPython/pythonProject/scoreOfClustering.txt" first_set = frog_data.iloc[:, 1:1327] k_means(first_set, "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_1.xlsx", "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_2.png", tLabel, scoreFile, "Set_1")

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