这段代码在做什么def zgrid(): global X,Gn, ystart, dy, xstart, dx, mean, std, C, Threshold prepare() # os.system("exit(0)") makegrid() getCellCount() mean = np.mean(CellCount) caculateAllDensitys() #drawSurface() Threshold = getThreshold() # *0.4#*1.25 print("Dataset=", Dataset, "N=", N, "Gn=", Gn, "Threshold=", Threshold, "N/(Gn*Gn)=", N/(Gn*Gn)) # Draw3DBar() # return rr = 0 for x in range(Ev,Gn-Ev): for y in range(Ev,Gn-Ev): if VirtualDensity[x][y] > Threshold: l = testNeighbour(x, y) # 看看邻居的簇号 ln=len(l) if ln == 1: CellCluster[x][y] = l[0] elif ln == 0: rr += 1 CellCluster[x][y] = rr else:#CellCluster[x][y] = 99 combin(x,y,l) removeSmallCluster() #compete() # step2:competition扩展簇 makeCluster() maintianCluster() # orderClusterNo() & delete small clusters time1 = time.perf_counter() print('program eclipes:', time1-time0) fig = plt.figure(figsize=(3,3),dpi=300) return # bypass drawing rectangle AX=fig.add_subplot(111) for x in range(Gn): for y in range(Gn): #if CellCluster[x][y] >0: drawReactangle(x, y, 'b', 0.2,AX) #drawDensity(x, y, 'b', 0.1,AX) print("done!") return
时间: 2023-12-04 07:04:17 浏览: 22
这段代码定义了一个名为zgrid()的函数,该函数的功能是对数据进行网格化处理并进行聚类。具体实现步骤如下:
1. 调用prepare()函数进行数据准备,包括读取数据、对数据进行预处理等;
2. 调用makegrid()函数对数据进行网格化处理;
3. 调用getCellCount()函数获取每个网格内数据点的数量;
4. 调用caculateAllDensitys()函数计算每个网格内的密度;
5. 调用getThreshold()函数计算阈值;
6. 遍历每个网格,根据其虚拟密度和阈值来确定其所属的簇;
7. 调用removeSmallCluster()函数删除小簇;
8. 调用makeCluster()函数对簇进行合并;
9. 调用maintainCluster()函数对簇进行维护和排序;
10. 最后,绘制聚类结果的矩形图并返回。
该函数的主要作用是对数据进行聚类分析,并将聚类结果可视化。
相关问题
核密度估计python代码3D波浪图
以下是一个简单的核密度估计的Python代码,可以生成3D波浪图:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from scipy.stats import kde
# 生成数据
x = np.random.normal(size=500)
y = np.random.normal(size=500)
z = np.random.normal(size=500)
# 计算核密度估计
density = kde.gaussian_kde([x, y, z])
xgrid, ygrid, zgrid = np.mgrid[min(x):max(x):100j, min(y):max(y):100j, min(z):max(z):100j]
coords = np.vstack([item.ravel() for item in [xgrid, ygrid, zgrid]])
density_values = density(coords).reshape(xgrid.shape)
# 绘制3D波浪图
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
ax.plot_surface(xgrid, ygrid, zgrid, rstride=1, cstride=1, facecolors=plt.cm.viridis(density_values))
ax.set_xlabel('X')
ax.set_ylabel('Y')
ax.set_zlabel('Z')
plt.show()
```
这段代码首先生成了三个正态分布的随机变量(x、y和z)。然后,使用`gaussian_kde`函数计算核密度估计值,并将其存储在`density_values`中。最后,使用`plot_surface`函数将三维图形绘制出来。
空间核密度估计中的空间动态核密度估计的三维图matlab代码
### 回答1:
以下是一个简单的三维空间动态核密度估计的 MATLAB 代码:
```matlab
% 生成数据集
n = 500;
x = randn(n,1);
y = randn(n,1);
z = randn(n,1);
% 定义核函数和带宽参数
kernel = 'gaussian';
bw = 0.5;
% 计算空间动态核密度估计
ngrid = 50;
xgrid = linspace(min(x),max(x),ngrid);
ygrid = linspace(min(y),max(y),ngrid);
zgrid = linspace(min(z),max(z),ngrid);
[X,Y,Z] = meshgrid(xgrid,ygrid,zgrid);
F = ksdensity([x,y,z],[X(:),Y(:),Z(:)],'Kernel',kernel,'Bandwidth',bw);
% 绘制三维图
figure;
isosurface(X,Y,Z,reshape(F,ngrid,ngrid,ngrid),0.2);
axis equal;
xlabel('x');
ylabel('y');
zlabel('z');
title('空间动态核密度估计');
```
这段代码生成一个500个三维随机样本的数据集,并计算它们的空间动态核密度估计。然后,它使用 isosurface 函数将估计结果可视化为三维图形。请注意,这段代码中的带宽参数是手动设置的,可以根据数据集的特性进行调整。
### 回答2:
以下是使用MATLAB绘制空间动态核密度估计的三维图的代码:
```matlab
% 假设已有空间点数据集 points,其中每行表示一个数据点的空间坐标 (x, y, z)
% 假设需要进行核密度估计的点的范围为 x 轴 [-10, 10],y 轴 [-10, 10],z 轴 [-10, 10]
% 假设每个维度上的步长为0.1
% 定义空间点的范围和步长
xRange = -10:0.1:10;
yRange = -10:0.1:10;
zRange = -10:0.1:10;
% 初始化空间动态核密度数组
density = zeros(length(xRange), length(yRange), length(zRange));
% 计算每个空间点的核密度
for i = 1:length(points)
x = points(i, 1);
y = points(i, 2);
z = points(i, 3);
% 根据高斯核函数计算每个点的密度贡献
density = density + exp(-(xRange - x).^2 - (yRange - y).^2 - (zRange - z).^2);
end
% 根据点的数量对密度进行归一化
density = density ./ length(points);
% 绘制三维图
[X, Y, Z] = meshgrid(xRange, yRange, zRange);
figure;
isosurface(X, Y, Z, density, 0.05);
axis([-10 10 -10 10 -10 10]);
xlabel('X');
ylabel('Y');
zlabel('Z');
title('Spatial Dynamic Kernel Density Estimation');
```
该代码首先定义了空间点的范围和步长,然后初始化空间动态核密度数组。接着使用高斯核函数计算每个空间点的密度贡献,并将结果累加到空间动态核密度数组中。最后,根据点的数量对密度进行归一化,并使用isosurface函数绘制三维图形。图形的x轴、y轴和z轴范围为[-10, 10],标题为"Spatial Dynamic Kernel Density Estimation"。
### 回答3:
空间动态核密度估计是一种用于分析数据集中点在空间上的分布情况的方法。它通过使用核密度估计方法,在空间上生成一个平滑的密度图。以下是使用MATLAB编写的空间动态核密度估计的三维图代码:
```matlab
% 导入数据集
load('dataset.mat'); % 请替换为您的数据集
% 设置空间范围
x = dataset(:, 1);
y = dataset(:, 2);
z = dataset(:, 3);
% 设置核密度估计参数
bandwidth = 2; % 请根据数据集进行调整
% 生成网格
[X, Y, Z] = meshgrid(min(x):0.1:max(x), min(y):0.1:max(y), min(z):0.1:max(z));
% 计算空间动态核密度估计
density = ksdensity3d([x, y, z], [X(:), Y(:), Z(:)], 'Bandwidth', bandwidth);
% 将结果转换为三维矩阵
density_matrix = reshape(density, size(X));
% 绘制三维图
figure;
slice(X, Y, Z, density_matrix, max(x), max(y), max(z));
xlabel('X');
ylabel('Y');
zlabel('Z');
title('空间动态核密度估计');
colorbar;
% 保存图像
saveas(gcf, 'density_plot.png'); % 请替换为您想保存的文件名和格式
```
请注意,上述代码中使用的数据集为`dataset.mat`,您需要将其替换为您实际使用的数据集。另外,还可以根据数据集的特点调整核密度估计的参数`bandwidth`来获得最佳效果。最后,您可以根据需要修改图形的标题、坐标轴标签和保存的文件名。