mlr3,训练集比验证集等于7:3,实现SHAP可视化R代码
时间: 2024-12-19 22:16:33 浏览: 9
mlr3是一个流行的R语言机器学习库,它提供了一个统一的框架用于模型选择、特征选择和预测建模。当你有一个训练集(70%的数据)和验证集(30%的数据),并想使用SHAP(SHapley Additive exPlanations)进行模型解释,你可以按照以下步骤进行:
首先,你需要安装必要的包,包括`mlr3`, `mlr3learners`, 和 `mlr3viz`。可以使用下面的命令安装:
```R
install.packages("mlr3")
install.packages("mlr3learners")
install.packages("mlr3viz")
```
假设你已经加载了数据,并将数据分为训练集(train)和验证集(test),可以使用`mlr3`创建任务并训练模型。这里以线性回归为例:
```R
library(mlr3)
library(mlr3learners)
library(mlr3viz)
# 创建任务
task <- make_regr_task(data = your_data, target = "your_target_column")
# 划分数据
set.seed(42) # 设置随机种子保证结果可复现
index_train <- sample(task$nrow, 0.7 * task$nrow)
index_test <- task[index_train, ]
test_set <- task[index_test, ]
# 训练模型
learner <- lrn("regr:sarsa") # 使用SARSA回归器作为示例
model_fit <- learner$train(train_set)
```
接下来,使用`mlr3pipelines`来应用SHAP值:
```R
library(mlr3pipelines)
# SHAP管道
shap_pipe <- make_pipeline(
learner,
msr("classif.shap", store_shap = TRUE) # 使用mlr3measures中的SHAP测量器
)
# 应用到测试集上
shap_results <- shap_pipe$predict(test_set)
```
最后,你可以通过`mlr3viz::autoplot_shap()`生成可视化:
```R
library(mlr3viz)
# 可视化
autoplot(shap_results$importance, test_set$data) # 或者传入具体样本id
```
这将显示每个特征对目标变量的影响程度。记得替换`your_data`和`your_target_column`为你实际的数据和目标列名。
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