R语言计算贝叶斯模型的交叉验证误差和训练误差的代码
时间: 2024-05-09 20:15:41 浏览: 89
以下是使用R语言计算贝叶斯模型的交叉验证误差和训练误差的示例代码:
```R
# 加载所需的包
library(mlr)
library(mlrMBO)
library(mlrCPO)
library(ParamHelpers)
library(ggplot2)
library(MASS)
# 加载数据集
data(iris)
# 创建贝叶斯模型
bayes_model <- makeLearner("classif.bayes", predict.type = "prob")
# 定义参数空间
param_space <- makeParamSet(
makeIntegerParam("method", lower = 1, upper = 2),
makeNumericParam("threshold", lower = 0, upper = 1)
)
# 定义交叉验证和训练误差的评估指标
cv_error <- makeLearnerMeasure("classif.ce", predict.type = "prob")
train_error <- makeLearnerMeasure("classif.ce", predict.type = "prob")
# 进行交叉验证
cv <- makeResampleDesc("CV", iters = 5, stratify = TRUE)
cv_result <- resample(bayes_model, iris, resampling = cv, measures = cv_error)
# 计算交叉验证误差
cv_error <- mean(cv_result$measures[[1]])
# 计算训练误差
train_error <- train(bayes_model, iris, measures = train_error)$measures[[1]]
# 输出结果
print(paste0("交叉验证误差: ", cv_error))
print(paste0("训练误差: ", train_error))
```
上述代码中,我们使用了 mlr 包来创建贝叶斯模型,并使用 mlrMBO 包中的 makeParamSet 函数定义了参数空间。接着,我们使用 makeLearnerMeasure 函数定义了交叉验证和训练误差的评估指标,然后使用 resample 函数进行交叉验证,并使用 train 函数计算训练误差。最后,我们输出了交叉验证误差和训练误差的结果。
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