# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]) colnames(f1_split) <- "staxids_X",要求有缺失值的列不删除

时间: 2024-03-03 15:49:57 浏览: 25
如果要保留有缺失值的列,您可以将缺失值替换为一个标识符,例如"NA",然后再运行代码。以下是修改后的代码: ``` f1[, 1][is.na(f1[, 1])] <- "NA" f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]) colnames(f1_split) <- "staxids_X" f1 <- cbind(f1_split[, 1], f1[, -1]) f1[f1 == "NA"] <- NA ``` 这个代码将f1中的缺失值替换为"NA",然后将f1的第一列按照";"分割成多个列,只保留第一个子串,然后将新的一列添加到f1的最左边。最后将"NA"替换为NA值,以便后续的处理。这样就可以保留有缺失值的列了。
相关问题

# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 根据这个要求 再修改一下上面这串代码

好的,根据您的要求,以下是修改后的代码: ``` # 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE] colnames(f1_split) <- "col1" # 在f1中添加新的列 f1 <- cbind(f1, f1_split[, -1]) f1[is.na(f1)] <- "" # 遍历f1的第一列的字段 for (i in 1:nrow(f1)) { # 如果第一列为空,跳过 if (f1[i, 1] == "") { next } # 取第一个子串与f2的第一列进行比较 key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1] match_row <- f2 %>% filter(col1_f2 == key) # 如果找到了匹配的行 if (nrow(match_row) > 0) { # 将右文件的后两列连接到左文件中 f1[i, 2:3] <- match_row[1, 2:3] } else { # 如果找不到匹配的行,用NA填充 f1[i, 2:3] <- NA } } # 输出结果到csv文件 write.csv(f1, "output.csv", row.names = FALSE) ``` 这段代码与之前的代码相比,只是将分割成多个列后只保留第一列,并且在处理空串时添加了一个判断。其他部分与之前的代码相同。

library(dplyr) # 读入两个csv文件 f1 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/【1】output_summary.csv", stringsAsFactors = FALSE) f2 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/fullnamelineage_staxids_X.csv", stringsAsFactors = FALSE) # 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1[f1 == ""] <- NA f1[, 1][is.na(f1[, 1])] <- "NA" f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]) colnames(f1_split) <- "staxids_X" # 在f1中添加新的列 f1 <- cbind(f1_split[, 1], f1[, -1]) f1[is.na(f1)] <- "" # 取第一个子串与f2的第一列进行比较 key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1] match_row <- f2 %>% filter(staxids_X == key) # 如果找到了匹配的行 if (nrow(match_row) > 0) { # 将右文件的后两列连接到左文件中 f1[i, 2:3] <- match_row[1, 2:3] } else { # 如果找不到匹配的行,用NA填充 f1[i, 2:3] <- NA } } # 输出结果到csv文件 write.csv(f1, "/Users/imac/Desktop/left_join/output.csv", row.names = FALSE)按照要求改一下这段代码,

好的,您的要求是将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一个子串与f2的第一列进行比较,同时将匹配到的行的根和分类信息合并到f1的最后两列中,找不到匹配的行时,根和分类信息列中的值都填充为NA,并将结果输出到csv文件中。修改后的代码如下: ``` library(dplyr) # 读入两个csv文件 f1 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/【1】output_summary.csv", stringsAsFactors = FALSE) f2 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/fullnamelineage_staxids_X.csv", stringsAsFactors = FALSE) # 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一个子串 f1_split <- f1 %>% separate(col = V1, into = paste0("V", 1:10), sep = ";", fill = "right") %>% select(-starts_with("V")) %>% mutate(staxids_X = first(V1)) # 在f1中添加新的列 f1 <- cbind(f1_split[, "staxids_X"], f1_split[, -1]) # 取第一个子串与f2的第一列进行比较 for (i in 1:nrow(f1)) { key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1] match_row <- f2 %>% filter(staxids_X == key) if (nrow(match_row) > 0) { # 将右文件的后两列连接到左文件中 f1[i, c("root_x", "lineage_x")] <- match_row[1, c("root", "lineage")] } else { # 如果找不到匹配的行,用NA填充root_x和lineage_x f1[i, c("root_x", "lineage_x")] <- NA } } # 输出结果到csv文件 write.csv(f1, "/Users/imac/Desktop/left_join/output.csv", row.names = FALSE) ``` 请注意,由于您的数据文件路径可能不同,需要根据实际情况修改文件路径。

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