# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]) colnames(f1_split) <- "staxids_X",要求有缺失值的列不删除
时间: 2024-03-03 15:49:57 浏览: 25
如果要保留有缺失值的列,您可以将缺失值替换为一个标识符,例如"NA",然后再运行代码。以下是修改后的代码:
```
f1[, 1][is.na(f1[, 1])] <- "NA"
f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE])
colnames(f1_split) <- "staxids_X"
f1 <- cbind(f1_split[, 1], f1[, -1])
f1[f1 == "NA"] <- NA
```
这个代码将f1中的缺失值替换为"NA",然后将f1的第一列按照";"分割成多个列,只保留第一个子串,然后将新的一列添加到f1的最左边。最后将"NA"替换为NA值,以便后续的处理。这样就可以保留有缺失值的列了。
相关问题
# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 根据这个要求 再修改一下上面这串代码
好的,根据您的要求,以下是修改后的代码:
```
# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列
f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]
colnames(f1_split) <- "col1"
# 在f1中添加新的列
f1 <- cbind(f1, f1_split[, -1])
f1[is.na(f1)] <- ""
# 遍历f1的第一列的字段
for (i in 1:nrow(f1)) {
# 如果第一列为空,跳过
if (f1[i, 1] == "") {
next
}
# 取第一个子串与f2的第一列进行比较
key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1]
match_row <- f2 %>% filter(col1_f2 == key)
# 如果找到了匹配的行
if (nrow(match_row) > 0) {
# 将右文件的后两列连接到左文件中
f1[i, 2:3] <- match_row[1, 2:3]
} else {
# 如果找不到匹配的行,用NA填充
f1[i, 2:3] <- NA
}
}
# 输出结果到csv文件
write.csv(f1, "output.csv", row.names = FALSE)
```
这段代码与之前的代码相比,只是将分割成多个列后只保留第一列,并且在处理空串时添加了一个判断。其他部分与之前的代码相同。
library(dplyr) # 读入两个csv文件 f1 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/【1】output_summary.csv", stringsAsFactors = FALSE) f2 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/fullnamelineage_staxids_X.csv", stringsAsFactors = FALSE) # 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1[f1 == ""] <- NA f1[, 1][is.na(f1[, 1])] <- "NA" f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]) colnames(f1_split) <- "staxids_X" # 在f1中添加新的列 f1 <- cbind(f1_split[, 1], f1[, -1]) f1[is.na(f1)] <- "" # 取第一个子串与f2的第一列进行比较 key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1] match_row <- f2 %>% filter(staxids_X == key) # 如果找到了匹配的行 if (nrow(match_row) > 0) { # 将右文件的后两列连接到左文件中 f1[i, 2:3] <- match_row[1, 2:3] } else { # 如果找不到匹配的行,用NA填充 f1[i, 2:3] <- NA } } # 输出结果到csv文件 write.csv(f1, "/Users/imac/Desktop/left_join/output.csv", row.names = FALSE)按照要求改一下这段代码,
好的,您的要求是将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一个子串与f2的第一列进行比较,同时将匹配到的行的根和分类信息合并到f1的最后两列中,找不到匹配的行时,根和分类信息列中的值都填充为NA,并将结果输出到csv文件中。修改后的代码如下:
```
library(dplyr)
# 读入两个csv文件
f1 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/【1】output_summary.csv", stringsAsFactors = FALSE)
f2 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/fullnamelineage_staxids_X.csv", stringsAsFactors = FALSE)
# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一个子串
f1_split <- f1 %>%
separate(col = V1, into = paste0("V", 1:10), sep = ";", fill = "right") %>%
select(-starts_with("V")) %>%
mutate(staxids_X = first(V1))
# 在f1中添加新的列
f1 <- cbind(f1_split[, "staxids_X"], f1_split[, -1])
# 取第一个子串与f2的第一列进行比较
for (i in 1:nrow(f1)) {
key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1]
match_row <- f2 %>% filter(staxids_X == key)
if (nrow(match_row) > 0) {
# 将右文件的后两列连接到左文件中
f1[i, c("root_x", "lineage_x")] <- match_row[1, c("root", "lineage")]
} else {
# 如果找不到匹配的行,用NA填充root_x和lineage_x
f1[i, c("root_x", "lineage_x")] <- NA
}
}
# 输出结果到csv文件
write.csv(f1, "/Users/imac/Desktop/left_join/output.csv", row.names = FALSE)
```
请注意,由于您的数据文件路径可能不同,需要根据实际情况修改文件路径。