# 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE]) colnames(f1_split) <- "staxids_X",要求有缺失值的列不删除
时间: 2024-03-03 09:49:57 浏览: 60
如果要保留有缺失值的列,您可以将缺失值替换为一个标识符,例如"NA",然后再运行代码。以下是修改后的代码:
```
f1[, 1][is.na(f1[, 1])] <- "NA"
f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE])
colnames(f1_split) <- "staxids_X"
f1 <- cbind(f1_split[, 1], f1[, -1])
f1[f1 == "NA"] <- NA
```
这个代码将f1中的缺失值替换为"NA",然后将f1的第一列按照";"分割成多个列,只保留第一个子串,然后将新的一列添加到f1的最左边。最后将"NA"替换为NA值,以便后续的处理。这样就可以保留有缺失值的列了。
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library(dplyr) # 读入两个csv文件 f1 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/【1】output_summary.csv", stringsAsFactors = FALSE) f2 <- read.csv("/Users/imac/Desktop/left_join/fullnamelineage_staxids_X.csv", stringsAsFactors = FALSE) # 将f1的第一列按照;分割成多个列,只保留第一列 f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE] colnames(f1_split) <- "staxids_X" # 在f1中添加新的列 f1 <- cbind(f1_split[, 1], f1[, -1]) f1[is.na(f1)] <- "" # 遍历f1的第一列的字段 for (i in 1:nrow(f1)) { # 如果第一列为空,跳过 if (f1[i, 1] == "") { next } # 取第一个子串与f2的第一列进行比较 key <- strsplit(as.character(f1[i, 1]), ";", fixed = TRUE)[[1]][1] match_row <- f2 %>% filter(col1_f2 == key) # 如果找到了匹配的行 if (nrow(match_row) > 0) { # 将右文件的后两列连接到左文件中 f1[i, 2:3] <- match_row[1, 2:3] } else { # 如果找不到匹配的行,用NA填充 f1[i, 2:3] <- NA } } # 输出结果到csv文件 write.csv(f1, "output.csv", row.names = FALSE)这串代码有吗
这段代码没有语法错误。这段代码的作用是将f1和f2两个csv文件进行左连接,并将结果输出到output.csv文件中。在这个过程中,首先将f1的第一列按照";"分割成多个列,只保留第一个子串,然后将新的一列添加到f1的最左边。然后遍历f1的第一列的所有字段,取第一个子串与f2的第一列进行比较,并将f2中匹配的行的后两列连接到f1中。如果找不到匹配的行,则在f1中对应的行填充NA值。最后,将结果输出到output.csv文件中。
> f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE] + colnames(f1_split) <- "staxids_X" Error: unexpected symbol in: "f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE] colnames" > 怎么回事
这个错误是由于代码的第一行和第二行没有分号或者换行符分隔开导致的。您可以将代码修改为:
```
f1_split <- data.frame(do.call("rbind", strsplit(as.character(f1[, 1]), ";", fixed = TRUE))[, 1, drop = FALSE])
colnames(f1_split) <- "staxids_X"
```
这样就可以避免这个错误了。
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