下面这段代码哪里出错了?p_list <- list() for (i in 2:ncol(data)) { res <- rcorr(data[,i], data[,i+11]) p_value <- signif(res$P[1,2], 2) cor_value <- round(res$r[1,2], 2)}
时间: 2024-03-14 09:45:14 浏览: 21
这段代码中出现了几个问题:
1. 在循环开始前,没有定义 `data` 变量,需要先定义并赋值。
2. 循环中,`cor_value` 与 `p_value` 变量在每次循环中都被重新定义,导致最后得到的只是最后一次循环结果,需要将这两个变量定义在循环外部,并使用列表 `p_list` 存储每次循环的结果。
修改后的代码如下:
```
data <- matrix(rnorm(100), ncol=12)
p_list <- list()
cor_value <- NULL
p_value <- NULL
for (i in 2:ncol(data)-11) {
res <- rcorr(data[,i], data[,i+11])
p_value <- signif(res$P[1,2], 2)
cor_value <- round(res$r[1,2], 2)
p_list[[i]] <- list(cor=cor_value, p=p_value)
}
p_list
```
这个代码会随机生成一个100行12列的数据矩阵,并针对每列数据与对应后11列数据进行相关系数计算,最后将每次循环计算结果存储在 `p_list` 列表中。
相关问题
p_list <- list() for (i in 11) { res <- rcorr(data[,i], data[,i+11]) p_value <- signif(res$P[1,2], 2) cor_value <- round(res$r[1,2], 2) # 每次新建一个绘图数据框: data_new <- data[,c(i,i+11)] colnames(data_new) <- c("x", "y") p <- ggplot(data_new,aes(x = x, y = y))+ geom_point(color = "#988d7b")+ geom_smooth(method = "lm", formula = y ~ x, # 调整置信区间颜色: fill = "#b2e7fa", color = "#00aeef", alpha = 0.8)+ theme_bw()+ ylab(colnames(data)[i])+ theme( # 去除网格线: panel.grid = element_blank(), # 修改坐标轴标签 axis.title = element_text(face = "bold.italic"), # 标题居中: plot.title = element_text(hjust = 0.5, size = 10) )+ labs(title = paste0("r =", cor_value, ", q = ", p_value)) p_list[[i-1]] <- p }
这段代码中有一个问题:
1. 循环中的 `i` 只被赋值为了数字 `11`,应该将循环条件改为 `2:ncol(data)-11`,以便按顺序依次计算每列数据与后11列数据的相关系数,并绘制散点图。
修改后的代码如下:
```
data <- matrix(rnorm(100), ncol=12)
p_list <- list()
cor_value <- NULL
p_value <- NULL
for (i in 2:ncol(data)-11) {
res <- rcorr(data[,i], data[,i+11])
p_value <- signif(res$P[1,2], 2)
cor_value <- round(res$r[1,2], 2)
# 每次新建一个绘图数据框:
data_new <- data[,c(i,i+11)]
colnames(data_new) <- c("x", "y")
p <- ggplot(data_new,aes(x = x, y = y))+
geom_point(color = "#988d7b")+
geom_smooth(method = "lm", formula = y ~ x,
# 调整置信区间颜色:
fill = "#b2e7fa", color = "#00aeef", alpha = 0.8)+
theme_bw()+
ylab(colnames(data)[i])+
theme(
# 去除网格线:
panel.grid = element_blank(),
# 修改坐标轴标签
axis.title = element_text(face = "bold.italic"),
# 标题居中:
plot.title = element_text(hjust = 0.5, size = 10)
)+
labs(title = paste0("r =", cor_value, ", q = ", p_value))
p_list[[i-1]] <- p
}
p_list
```
这个代码会随机生成一个100行12列的数据矩阵,并对每列数据与对应后11列数据进行相关系数计算并绘制散点图,最后将每次循环绘制的图存储在 `p_list` 列表中。
library(terra) path1 <- dir('G:/ERA5hr/SVWL1/1/',pattern = '*.tif',full.names = T)#导入地址后批量合并 path2 <- raster('G:/ERA5hr/Fw/a/a.tif') path3 <- raster('G:/ERA5hr/Fw/b/b.tif') path4 <- raster('G:/ERA5hr/Fw/wr/wr.tif') #nc5 <- stack(paths) for (i in 1:length(path1)){ print(path1[i]) sw <- stack(path1[i]) a <- path2 b <- path3 wr <- path4 df_a <- as.matrix(a) df_b <- as.matrix(b) df_wr <- as.matrix(wr) df_sw <- as.matrix(sw) old_matrix <- df_sw df_sw <- matrix(old_matrix, nrow = 125, ncol = 265) file_data <- ifelse(is.na(df_sw), 0, ifelse(df_sw < df_wr, 1, sqrt(1 + df_a * (df_sw - df_wr) ^ df_b))) result <- sw result <- setValues(result, file_data) output_path <- paste('G:/ERA5hr/Fw/1/', substr(path1[i],19,32),'.tif',sep='') writeRaster(result,output_path, overwrite=TRUE,format = "GTiff") }请检查一下参数问题
在你的代码中,你使用了 `path2`、`path3`和`path4`作为模板来创建新的栅格图层。但是,在循环中,你没有更新这些模板图层,而是一直使用了最初的图层。另外,你在将栅格数据转换为矩阵时,没有指定数据类型,这可能导致数据类型不匹配和错误。
以下是修复后的代码:
```
library(terra)
# 导入地址后批量合并
path1 <- dir('G:/ERA5hr/SVWL1/1/',pattern = '*.tif',full.names = T)
path2 <- rast('G:/ERA5hr/Fw/a/a.tif')
path3 <- rast('G:/ERA5hr/Fw/b/b.tif')
path4 <- rast('G:/ERA5hr/Fw/wr/wr.tif')
for (i in 1:length(path1)) {
print(path1[i])
sw <- rast(path1[i])
# 更新模板图层
a <- path2
b <- path3
wr <- path4
# 将栅格数据转换为矩阵并指定数据类型
df_a <- as.matrix(a, dataType = 'FLT4S')
df_b <- as.matrix(b, dataType = 'FLT4S')
df_wr <- as.matrix(wr, dataType = 'FLT4S')
df_sw <- as.matrix(sw)
old_matrix <- df_sw
df_sw <- matrix(old_matrix, nrow = 125, ncol = 265)
file_data <- ifelse(is.na(df_sw), 0, ifelse(df_sw < df_wr, 1, sqrt(1 + df_a * (df_sw - df_wr) ^ df_b)))
result <- sw
result <- setValues(result, file_data)
output_path <- paste('G:/ERA5hr/Fw/1/', substr(path1[i],19,32),'.tif',sep='')
writeRaster(result,output_path, overwrite=TRUE, format = "GTiff")
}
```
现在,你应该能够成功执行你的代码了。