model <- gam(Y ~ s(X1)+s(X2)+s(X3)+s(X4), data = dat, family = gaussian) summary(model) cv_model <- cv.gam(model, K = 10) # K为交叉验证折数 summary(cv_model) # 预测值 library(ggeffects) pred <- ggpredict(model, terms = c("X1", "X2", "X3", "X4")) # 图像处理 # 绘制GAM图,可以使用ggplot2包: merged_list <- Reduce(function(x, y) c(x, y), list("X1", "X2", "X3", "X4")) gg.gam <- ggplot(pred, aes(x = x, y = predicted, color = predicted)) + geom_point(size = 3) + labs(x = "Predictor", y = "Output") + ggtitle("Output vs Predictor") + xlab("Predictor") + ylab("Output") + scale_color_gradient(low = "blue", high = "red", name = "Output") print(gg.gam)解释下x = "Predictor", y = "Output"输出的图形中,Predictor范围为0到1,Output的范围0到1.5
时间: 2023-11-11 22:02:28 浏览: 93
在这个模型中,自变量X1、X2、X3和X4都已经被转化为了平滑项,因此在GAM图中,我们看到的是自变量的变化对因变量的影响,而不是自变量本身的取值。因此,x轴上的Predictor并不代表自变量的实际取值,而是代表自变量的变化范围,通常是从自变量的最小值到最大值。y轴上的Output则代表因变量的预测值,其取值范围是0到1.5,因为我们使用了高斯分布作为响应变量的分布,这意味着因变量的取值范围应该是0到正无穷,但是在这个模型中,因变量的最大取值只有1.5。这可能是由于数据本身的限制导致的,或者是模型拟合出现了一些问题。总之,这个GAM图可以帮助我们更好地理解自变量与因变量之间的关系,但需要注意它的范围和局限性。
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dat =as.data.frame(data1) colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','Y') mod_gam <- gam(Y ~ s(X1)+s(X2)+s(X3)+s(X4),data=dat) summary(mod_gam)
这段代码使用了R语言中的mgcv包,将data1数据框转换为dat数据框,并给每个变量命名。然后,使用gam函数拟合了一个基于平滑项的广义可加模型(Generalized Additive Model, GAM),其中响应变量Y与四个自变量X1、X2、X3、X4之间的关系都用平滑项来拟合。最后,使用summary函数输出了模型的统计结果,包括每个平滑项的edf、F值和p值,以及模型的R-squared(adj)和Deviance explained等评估指标。
model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian) summary(model)如何对sp进行修改
在R语言中,GAM模型中的参数主要包括平滑函数的度数、平滑函数的类型和正则化参数等。其中,平滑函数的类型和正则化参数可以通过修改参数sp来进行调整。参数sp控制了平滑函数的光滑程度,值越小表示平滑函数越光滑,值越大表示平滑函数越不光滑。
如果你已经拟合了一个GAM模型,并且想要修改其中某个变量的sp参数,可以通过以下步骤进行修改:
1. 找到要修改的变量对应的平滑函数;
2. 修改该平滑函数的sp参数;
3. 更新GAM模型。
例如,以下代码展示了如何修改第一个自变量X1对应的平滑函数的sp参数。
```R
# 原始模型
model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian)
# 修改X1对应的平滑函数的sp参数为0.7
model$smooth[[1]]$sp <- 0.7
# 更新GAM模型
model <- update(model)
```
以上代码中,首先定义了一个GAM模型,并且指定了每个变量对应的平滑函数和对应的sp参数。然后,通过修改第一个变量X1对应的平滑函数的sp参数为0.7,再通过update函数更新GAM模型。
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