drug_graph_label = drug_graph.to_dense()
时间: 2023-09-18 17:07:48 浏览: 40
这行代码将drug_graph稀疏张量转换为密集张量,即将稀疏矩阵转换为常规的二维矩阵。to_dense()函数将稀疏张量的值复制到一个密集张量中,其中缺少的值会被填充为0。这个密集张量drug_graph_label中的每个元素的值表示对应位置上的边权重。
需要注意的是,当稀疏张量中非零元素较少时,to_dense()操作会导致存储空间的大量浪费。因此,在处理稀疏张量时,应该尽量使用稀疏张量的算法,避免将其转换为密集张量。只有在必要时,才应该将稀疏张量转换为密集张量进行计算。
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drug_graph_label = drug_graph.to_dense() drug_random_mask = torch.rand_like(drug_graph_label) train_mask = drug_random_mask < train_ratio valid_mask = (drug_random_mask < (train_ratio + valid_ratio)) * (drug_random_mask >= train_ratio) test_mask = drug_random_mask >= (train_ratio + valid_ratio)解释一下
这段代码是为了将药物分子图数据集划分为训练集、验证集和测试集,并且使用随机掩码来进行划分。
首先,将药物分子图数据集转换为稠密矩阵形式,即 `drug_graph.to_dense()`。
接下来,使用与 `drug_graph_label` 相同形状的随机张量 `drug_random_mask`,其中随机值在 0 到 1 之间。这个随机掩码将被用于划分数据集。
然后,使用 `train_ratio` 将 `drug_random_mask` 划分为训练集,即 `train_mask = drug_random_mask < train_ratio`,其中小于 `train_ratio` 的随机值将被视为训练集。这个值通常是一个介于 0 到 1 之间的小数,例如 0.8 表示将 80% 的数据用于训练。
接下来,使用 `valid_ratio` 将 `drug_random_mask` 划分为验证集,即 `valid_mask = (drug_random_mask < (train_ratio + valid_ratio)) * (drug_random_mask >= train_ratio)`,其中小于 `train_ratio + valid_ratio` 且大于等于 `train_ratio` 的随机值将被视为验证集。这个值通常也是一个介于 0 到 1 之间的小数,例如 0.1 表示将 10% 的数据用于验证。
最后,将剩余的数据作为测试集,即 `test_mask = drug_random_mask >= (train_ratio + valid_ratio)`。
这样就可以将药物分子图数据集划分为训练集、验证集和测试集了。
drug_graph_label_train = drug_graph_label[train_mask].reshape(-1)
这行代码根据训练集掩码train_mask,从药物相互作用关系图的边权重矩阵drug_graph_label中选择训练集对应的部分,得到一个一维的训练集标签向量drug_graph_label_train。
具体来说,首先使用train_mask进行索引,选择drug_graph_label中train_mask对应位置为1的部分,得到一个二维的矩阵,其行数等于训练集中边的数量,列数等于药物相互作用关系图的边数。然后,使用reshape函数将该二维矩阵转换为一维的标签向量,其长度等于训练集中边的数量。
这种方式常用于图神经网络中的有监督学习任务,用于将图数据转化为向量数据,以便于输入到模型中进行训练。