运用DeepWalk对图进行嵌入并做网络重建,网络重建的结果用precision@5评价。给出python代码。

时间: 2024-03-23 13:38:52 浏览: 16
首先,需要安装 `networkx` 和 `gensim` 库。 以下是使用 DeepWalk 进行图嵌入和网络重建,并使用 precision@5 评价的 Python 代码: ```python import networkx as nx from gensim.models import Word2Vec # 加载图数据 G = nx.read_edgelist('graph.txt', nodetype=int) # 使用 DeepWalk 进行图嵌入 model = Word2Vec(nx.random_walk.RandomWalk(G, walk_length=10, num_walks=80), size=128, window=5, min_count=0, sg=1, workers=4) # 构建节点嵌入字典 embeddings = {} for node in G.nodes(): embeddings[node] = model.wv[str(node)] # 构建重建图 edges = [] nodes = list(G.nodes()) for i in range(len(nodes)): for j in range(i+1, len(nodes)): edges.append((nodes[i], nodes[j], -1 * sum([(embeddings[nodes[i]][k] - embeddings[nodes[j]][k]) ** 2 for k in range(128)]))) # 按权值从大到小排序 edges = sorted(edges, key=lambda x: x[2], reverse=True) # 构建重建图 new_G = nx.Graph() new_G.add_nodes_from(nodes) for i in range(len(nodes)): for j in range(i+1, len(nodes)): new_G.add_edge(nodes[i], nodes[j], weight=-1 * sum([(embeddings[nodes[i]][k] - embeddings[nodes[j]][k]) ** 2 for k in range(128)])) # 评价重建结果 precision_5 = 0 for node in nodes: neighbors = [n for n, _ in sorted(new_G[node].items(), key=lambda x: x[1]['weight'], reverse=True)[:5]] precision_5 += len(set(neighbors) & set(G[node])) / 5.0 print("Precision@5: %.4f" % (precision_5 / len(nodes))) ``` 在代码中,我们首先加载了图数据,然后使用 `gensim` 库中的 `Word2Vec` 模型对图进行嵌入学习。接着,我们将所有节点的嵌入向量存储到一个字典中。然后,我们根据节点之间的嵌入向量距离构建了一个重建图,其中边的权值是节点嵌入向量距离的相反数。最后,我们使用 `precision@5` 评价了重建图的效果。

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