运用DeepWalk对图进行嵌入并做链路预测,链路预测的结果用precision@k评价。给出python代码。
时间: 2024-03-23 17:38:22 浏览: 75
首先,需要安装deepwalk和networkx库,可以通过以下命令安装:
```
pip install deepwalk
pip install networkx
```
接下来,我们可以使用以下代码进行图嵌入和链路预测:
```python
import networkx as nx
from deepwalk import DeepWalk
from sklearn.metrics import precision_score
# 构建图
G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(0, 1), (0, 2), (1, 3), (2, 3), (2, 4), (3, 4), (3, 5)])
# 运行DeepWalk并得到嵌入
model = DeepWalk(G, walk_length=10, num_walks=80, workers=1)
model.train(window_size=5, iter=3)
embeddings = model.get_embeddings()
# 链路预测
test_edges = [(0, 4), (1, 4)]
y_true = [1, 0] # 1表示存在边,0表示不存在边
y_pred = []
for edge in test_edges:
u, v = edge
if u in embeddings and v in embeddings:
score = embeddings[u] @ embeddings[v] # 内积作为得分
y_pred.append(score)
precision = precision_score(y_true, [int(score > 0) for score in y_pred], average='binary')
print('Precision@1:', precision)
```
以上代码中,我们使用networkx库构建了一个简单的图,并使用DeepWalk对其进行嵌入。然后,我们选择了两条边进行链路预测,并使用precision@1作为评价指标。具体来说,我们计算了两个节点的嵌入向量的内积,并将其作为两个节点之间是否存在边的得分。然后,我们将得分大于0的视为存在边,得分小于等于0的视为不存在边,并计算precision@1。
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