不用sklearn库
时间: 2024-11-28 18:22:24 浏览: 5
DBSCAN算法实践(基于Python实现,非调用sklearn库)
如果你想不用scikit-learn(sklearn)库来实现MDS降维,你可以选择使用纯Python的numpy库以及matplotlib来进行可视化。下面是一个简单的例子:
首先,你需要安装pandas库来加载数据,如果你还没有安装,可以使用pip命令:
```bash
pip install pandas
```
然后,假设你已经有一个名为`data.csv`的文件,其中包含Iris数据集,你可以这样做:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import pdist, squareform
# 从csv文件加载数据
df = pd.read_csv('data.csv')
# 提取特征数据
X = df.values
# 计算样本之间的距离矩阵
dist_matrix = pdist(X)
# 转换为方阵
dist_matrix = squareform(dist_matrix)
# 初始化MDS对象
mds = MDS(n_components=2, dissimilarity="precomputed") # 对于距离矩阵,设置dissimilarity为预计算的
# 进行降维
embedding = mds.fit_transform(dist_matrix)
# 可视化降维结果
plt.scatter(embedding[:, 0], embedding[:, 1])
plt.title("Iris dataset MDS")
plt.xlabel("First Dimension")
plt.ylabel("Second Dimension")
plt.show()
```
注意:这个例子中我们手动计算了样本间距离矩阵,这是因为sklearn的MDS默认接受的是样本直接而不是距离矩阵。在sklearn中,由于内置了距离矩阵的处理,过程更简洁。
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