去除重复基因，保留重复基因的平均表达量，R语言代码

假设你的基因表达数据已经被储存在一个名为`gene_expression`的数据框中，其中每行为一个基因，每列为一个样本。你可以使用以下R语言代码来去除重复基因并保留平均表达量：

library(dplyr)

# 去除重复基因并计算平均表达量
gene_expression_filtered <- gene_expression %>%
  group_by(row.names(.)) %>%
  summarize_all(mean)

# 将行名恢复为"Gene"，列名恢复为样本ID
rownames(gene_expression_filtered) <- "Gene"
colnames(gene_expression_filtered) <- colnames(gene_expression)

# 输出结果
gene_expression_filtered

这段代码使用了`dplyr`包中的`group_by()`和`summarize_all()`函数，将基因按行分组，然后计算每个分组的平均表达量。最后，将结果数据框的行名和列名恢复为原始数据的格式。

相关问题

R语言中，如何将基因表达矩阵当中重复的基因去除保留一个，基因表达量为重复基因的平均表达量，简单的代码实现

你可以使用R语言中的dplyr包中的group_by和summarise函数来实现这个功能。具体代码如下：

library(dplyr)

# 读取基因表达矩阵
gene_expression_matrix <- read.csv("gene_expression_matrix.csv")

# 按照基因名称进行分组，计算每个基因的平均表达量
gene_expression_matrix_unique <- gene_expression_matrix %>%
  group_by(Gene) %>%
  summarise(Avg_Expression = mean(Expression))

# 输出结果
gene_expression_matrix_unique

其中，gene_expression_matrix.csv是你的基因表达矩阵文件，Gene和Expression是基因名称和对应的表达量列名。执行上述代码后，你将得到一个新的基因表达矩阵gene_expression_matrix_unique，其中每个基因只保留了一个，表达量为重复基因的平均表达量。

R语言中，如何将基因表达矩阵当中重复的基因去除保留一个，基因表达量为重复基因的平均表达量，最快的代码实现

可以使用R语言的dplyr包进行操作，具体代码如下：

library(dplyr)

# 假设数据框名为gene_exp，第一列为基因名称，其余列为基因表达量
gene_exp_unique <- gene_exp %>%
  group_by_at(vars(-1)) %>%  # 按除第一列外的其他列进行分组
  summarize(across(everything(), mean)) %>%  # 对每组计算平均值
  ungroup() %>%
  distinct()  # 去除重复行

# 输出结果，gene_exp_unique即为去重后的基因表达矩阵
gene_exp_unique

这段代码首先使用group_by_at函数按除第一列外的其他列进行分组，然后使用summarize函数对每组进行平均值计算，最后使用distinct函数去除重复行，得到去重后的基因表达矩阵gene_exp_unique。