数据集每一行有1034列,每列是一个节点,每个节点为一个特征。请帮我写出每一行对应的邻接矩阵和特征矩阵,邻接矩阵为1034行1034列。其中邻接矩阵,可以利用KNN来构造节点之间的连接关系。让KNN中的邻居数量为8。请帮我写出这个构建对称邻接矩阵的代码

时间: 2024-05-01 09:16:06 浏览: 110
以下是构建对称邻接矩阵的Python代码: ```python import numpy as np from sklearn.neighbors import kneighbors_graph # 读取数据集 data = np.loadtxt("dataset.txt") # 构建特征矩阵 features = data[:, :1034] # 构建邻接矩阵 adjacency = kneighbors_graph(features, n_neighbors=8, mode='connectivity', include_self=True) adjacency = (adjacency + adjacency.T) / 2.0 # 对称化 # 邻接矩阵和特征矩阵都可以直接使用了 print("邻接矩阵:", adjacency.toarray()) print("特征矩阵:", features) ``` 其中,`kneighbors_graph`函数可以利用KNN算法构建邻接矩阵,参数`n_neighbors`指定每个节点的邻居数量,`mode='connectivity'`表示只考虑连接关系而不考虑距离,`include_self=True`表示将每个节点与自身也视为邻居。 最后需要注意对称化邻接矩阵,使得它对应无向图。
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数据集每一行有1034列,每列是一个节点,每个节点为一个特征。请帮我写出每一行对应的邻接矩阵和特征矩阵,邻接矩阵为1034行1034列。其中邻接矩阵,可以利用KNN来构造节点之间的连接关系。让KNN中的邻居数量为8。请帮我写出这个构建邻接矩阵的代码

假设你的数据集为`data`,包含1034行1034列。那么,你可以使用`sklearn`库中的`NearestNeighbors`类来构建邻接矩阵。代码如下: ```python from sklearn.neighbors import NearestNeighbors import numpy as np # 构建邻接矩阵 n_neighbors = 8 # KNN中的邻居数量 nbrs = NearestNeighbors(n_neighbors=n_neighbors, algorithm='auto').fit(data) distances, indices = nbrs.kneighbors(data) adj_matrix = np.zeros((1034, 1034)) for i in range(1034): for j in indices[i]: adj_matrix[i][j] = 1 adj_matrix[j][i] = 1 # 构建特征矩阵 feature_matrix = data ``` 解释一下,`NearestNeighbors`类的`fit`方法用于拟合数据,返回一个拟合器。然后,`kneighbors`方法用于找到每个样本的最近邻,返回两个数组:距离数组和索引数组。这里我们只需要使用索引数组,将其转化为邻接矩阵即可。最后,特征矩阵就是原始数据集。

数据集有100行1035列,每一行有一个图数据,第一列为标签,剩下1034列为节点,每个节点包含一个特征。请帮我写出基于pytorch geometric实现以下功能代码:构造1034行1034列的邻接矩阵和1034行1列的特征矩阵,其中邻接矩阵可以利用KNN来构造节点之间的连接关系,邻居数量为8并且实现2个标签分类(图分类)。

以下是基于PyTorch Geometric实现构造邻接矩阵和特征矩阵的代码: ```python import torch from torch_geometric.utils import from_scipy_sparse_matrix from torch.nn import Sequential, Linear, ReLU import torch.nn.functional as F from torch_geometric.nn import GCNConv from sklearn.neighbors import kneighbors_graph # 构造图数据 data = torch.randn(100, 1035) labels = data[:, 0] features = data[:, 1:] # 构造邻接矩阵 adj_matrix = kneighbors_graph(features, n_neighbors=8, mode='connectivity') edge_index, _ = from_scipy_sparse_matrix(adj_matrix) # 构造特征矩阵 feature_matrix = torch.from_numpy(features).float() # 定义GCN网络 class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = GCNConv(1034, 16) self.conv2 = GCNConv(16, 2) def forward(self, x, edge_index): x = F.relu(self.conv1(x, edge_index)) x = self.conv2(x, edge_index) return F.log_softmax(x, dim=1) # 训练模型 model = Net() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01) for epoch in range(200): optimizer.zero_grad() out = model(feature_matrix, edge_index) loss = F.nll_loss(out[:50], labels[:50].long()) loss.backward() optimizer.step() print('Epoch', epoch, 'Loss', loss.item()) # 预测结果 model.eval() out = model(feature_matrix, edge_index) predicted = out.argmax(dim=1) print('Predicted labels:', predicted[:10]) print('True labels:', labels[:10]) ``` 说明: 1. 首先,我们从100行1035列的数据中分离出标签和特征; 2. 然后,通过`kneighbors_graph`函数构造1034行1034列的邻接矩阵,其中参数`n_neighbors=8`表示节点之间的最大邻居数量为8; 3. 接着,将邻接矩阵转换为PyTorch Geometric中的`edge_index`格式,并构造1034行1列的特征矩阵; 4. 然后,定义了一个包含两层GCN卷积层的网络结构,并使用Adam优化器进行训练; 5. 最后,我们对网络进行评估,并输出前10个预测标签和真实标签的比较结果。

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