我的数据集是data_3,请用这个数据集在python上写一个COX模型的决策曲线代码
时间: 2024-01-22 15:17:19 浏览: 74
决策树分类模型Python代码
好的,以下是使用Python的 lifelines 库来绘制 COX 模型的决策曲线的代码:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from lifelines import CoxPHFitter
from lifelines.utils import median_survival_times
from matplotlib import pyplot as plt
# 读取数据集
data = pd.read_csv("data_3.csv")
# 将时间和事件转换为lifelines所需的格式
T = data["time"]
E = data["event"]
# 使用CoxPHFitter拟合模型
cph = CoxPHFitter()
cph.fit(data, duration_col="time", event_col="event")
# 计算中位生存时间
median_survival_times(cph.predict_median(data))
# 绘制决策曲线
cph.plot_cumulative_hazard(data)
plt.show()
```
其中,`data_3.csv` 是数据集的文件名,需要将代码中的文件名替换为实际的文件名。在这个代码中,我们使用了 `CoxPHFitter` 类来拟合 COX 模型,并使用 `median_survival_times` 函数来计算中位生存时间。最后,使用 `plot_cumulative_hazard` 函数来绘制 COX 模型的决策曲线。
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