> hl <- hoslem.test(fit0$fitted.values, fit0$y) Error in quantile.default(yhat, probs = seq(0, 1, 1/g)) : (unordered) factors are not allowed

时间: 2024-02-23 10:01:15 浏览: 124
这个错误提示是因为`fit0$y`是一个无序的因子变量,而`hoslem.test`函数需要传入连续的数值型变量。 你可以先将`fit0$y`转换为数值型变量,再进行Hosmer-Lemeshow检验。假设`fit0$y`是一个二元变量,可以使用以下代码将其转换为数值型变量: ``` fit0$y <- as.numeric(levels(fit0$y))[fit0$y] ``` 然后再运行`hoslem.test`函数即可,例如: ``` hl <- hoslem.test(fit0$fitted.values, fit0$y) hl$p.value ``` 请注意,上述代码仅适用于二元变量。如果`fit0$y`是多元变量,需要根据具体情况进行转换。
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dir <- "G:/实用回归分析/" li5.1 <- read.csv(paste(dir, "li5.1.csv", sep=""),header = T) head(li5.1) li5.1 <- li5.1[,-(1:2)] y <- li5.1[,1] x <- cbind(1, as.matrix(li5.1[,-1])) # sample size n <- length(y) #dim of variable p <- dim(x)[2]-1 #original least square lm5.1 <- lm(y~., data=li5.1) #x <- scale(x)/sqrt(n-1) # anova(lm(y~1), lm5.1) # #residual vector e <- lm5.1$residuals #fitted value yhat <- lm5.1$fitted.values #残差图 plot(yhat, e) plot(e~yhat) #leverage vector # #HX=X # #H1=1 H <- x %*% solve(t(x) %*% x) %*% t(x) apply(H, 1, sum) apply(H, 2, sum) h <- diag(H) round(h, 4) hatvalues(lm5.1) #deleting residual ei <- as.vector(e/(1-h)) #the estimator of sigma sigma <- sqrt(sum(e^2)/(n-p-1)) #standard residual zre <- e/sigma #student residual sre <- e/(sigma*sqrt(1-h)) rstandard(lm5.1) library(MASS) stdres(lm5.1) #学生化残差图 plot(stdres(lm5.1)~yhat) #delete student residual srei <- sre*(1/sqrt((n-p-1)/(n-p-2)-sre^2/(n-p-2))) rstudent(lm5.1) studres(lm5.1) #MASS is.vector(studres(lm5.1)) which(abs(studres(lm5.1))>3) #center leverage vector centx <- scale(x[,-1],center=T,scale=F) ch <- diag(centx %*% solve(t(centx) %*% centx) %*% t(centx)) sum(ch) which(ch>3*mean(ch)) ch1 <- h-1/n #cook distance cookd <- cooks.distance(lm5.1) which(cookd>1) cook <- e^2/((p+1)*sigma^2)*h/(1-h)^2 plot(lm5.1)解释这段程序

这段程序的作用是进行线性回归模型的诊断和优化,并绘制相关的图形。 首先,程序设置数据文件的路径为 "G:/实用回归分析/",并读取名为 "li5.1.csv" 的 CSV 文件,将其转换为数据框 li5.1。然后删除数据框的前两列,将第一列赋值给 y,将其余列作为自变量构成的矩阵并添加截距项,赋值给 x。 接下来,程序计算样本量 n 和自变量个数 p。使用 lm() 函数拟合线性回归模型 lm5.1,计算残差 e 和拟合值 yhat。绘制残差图,使用 plot() 函数,分别绘制 yhat 和 e 的散点图以及 e 关于 yhat 的散点图。 然后,程序计算杠杆值和帽子值,使用 hatvalues() 函数计算帽子值,使用 apply() 函数计算杠杆值,并将其打印出来。计算标准化残差 zre 和学生化残差 sre,使用 rstandard() 函数和 stdres() 函数计算标准化残差。绘制学生化残差图,使用 plot() 函数,绘制 sre 关于 yhat 的散点图。 接下来,程序计算修正后的学生化残差 srei,使用 rstudent() 函数和 studres() 函数计算修正后的学生化残差,并使用 which() 函数找出绝对值大于3的学生化残差的位置。 然后,程序计算中心化杠杆值 ch,使用 diag() 函数计算中心化矩阵的对角元素,使用 apply() 函数计算中心化杠杆值,并打印出其总和以及绝对值大于 3 倍平均值的中心化杠杆值的位置。计算 Cook 距离 cookd 和 cook 值,使用 cooks.distance() 函数计算 Cook 距离,使用 e^2/((p+1)*sigma^2)*h/(1-h)^2 计算 cook 值。 最后,使用 plot() 函数对 lm5.1 进行绘图,绘制回归诊断图,包括标准化残差图、杠杆值图和 Cook 距离图。

基于以下R代码:data4_9 <- read_excel('C:/Users/apple/Desktop/课后题/E4_9.xlsx') library(tseries) adf.test(data4_9$x) Box.test(data4_9$x, type="Ljung-Box") diff_data <- diff(data4_9$x) library(forecast) fit <- auto.arima(diff_data) fit。绘制该序列的拟合图ARIMA(2,0,3)

以下是绘制该序列拟合图的代码: ```R library(ggplot2) library(forecast) # 读取数据 data4_9 <- read_excel('C:/Users/apple/Desktop/课后题/E4_9.xlsx') # 进行ADF检验和LB检验 adf.test(data4_9$x) Box.test(data4_9$x, type="Ljung-Box") # 差分 diff_data <- diff(data4_9$x) # 拟合ARIMA模型 fit <- arima(diff_data, order=c(2, 0, 3)) # 预测未来10个观测值 forecast <- forecast(fit, h=10) # 绘制拟合图 autoplot(data4_9$x) + geom_line(aes(y=diff_data), color="blue") + geom_line(aes(y=fitted(fit)), color="red") + geom_line(aes(y=forecast$mean), color="green") + labs(x="时间", y="数据值", title="ARIMA(2,0,3)模型拟合图") ``` 解释一下代码的各个部分: - `autoplot(data4_9$x)` 绘制原始序列的时间序列图。 - `geom_line(aes(y=diff_data), color="blue")` 绘制差分后的序列。 - `geom_line(aes(y=fitted(fit)), color="red")` 绘制ARIMA模型的拟合值。 - `geom_line(aes(y=forecast$mean), color="green")` 绘制ARIMA模型的未来10个观测值的预测值。 - `labs(x="时间", y="数据值", title="ARIMA(2,0,3)模型拟合图")` 添加横轴、纵轴和标题标签。 运行这段代码,就可以得到 ARIMA(2,0,3) 模型的拟合图了。
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“count <- 1 #说明是第几个模型 for (nhidden in 1:3) #一层隐藏层,选用1至3个隐藏单元 { ##考虑使用规则化方法建立多层感知器模型,考虑权衰减常数的四种取值 for (idecay in 1:4) { cdecay <- 0.1^idecay #权衰减常数为0.1的幂,幂的指数为idecay mlp_model <- mlp(x_train,y_train, inputsTest=x_valid,targetsTest=y_valid, maxit=300,size=c(nhidden), learnFunc ="BackpropWeightDecay", learnFuncParams=c(0.1,cdecay,0,0)) #使用mlp函数建立多层感知器模型。 # learnFunc ="BackpropWeightDecay"指定训练方法为带权衰减的向后传播算法。 # learnFuncParams的第一个元素为学习速率,这里指定为0.1;第二个元素为权衰减常数。 pred_prob_train <- mlp_model$fitted.values pred_class_train <- rep(1,length(traindata$Outcome)) pred_class_train[pred_prob_train[,2]>1/6] <- 2 Alltrainfit$nhidden[count] <- nhidden Alltrainfit$cdecay[count] <- cdecay Alltrainfit$totalloss[count] <- 5*length(pred_class_train[traindata$Outcome==1 & pred_class_train==0])+ 1*length(pred_class_train[traindata$Outcome==0 & pred_class_train==1]) pred_prob_valid <- mlp_model$fittedTestValues pred_class_valid <- rep(1,length(validdata$Outcome)) pred_class_valid[pred_prob_valid[,2]>1/6] <- 2 Allvalidfit$nhidden[count] <- nhidden Allvalidfit$cdecay[count] <- cdecay Allvalidfit$totalloss[count] <- 5*length(pred_class_valid[validdata$Outcome==1 & pred_class_valid==0])+ 1*length(pred_class_valid[validdata$Outcome==0 & pred_class_valid==1]) assign(paste("diabetes_MLP",nhidden,"_WD",idecay,sep=""),mlp_model) #将模型记录在指定名称(diabetes_MLP1_WD1等)的对象中。 count <- count+1 } } diabetes_MLP_models <- list(diabetes_MLP1_WD1,diabetes_MLP1_WD2, diabetes_MLP1_WD3,diabetes_MLP1_WD4, diabetes_MLP2_WD1,diabetes_MLP2_WD2, diabetes_MLP2_WD3,diabetes_MLP2_WD4, diabetes_MLP3_WD1,diabetes_MLP3_WD2, diabetes_MLP3_WD3,diabetes_MLP3_WD4) #将12个模型放在列表diabetes_MLP_Models中 diabetes_MLP_models saveRDS(diabetes_MLP_models,"out/diabetes_MLP_models.rds") #将该列表保留在文件中,以后可以用readRDS函数从文件中读取 readRDS("out/diabetes_MLP_models.rds") pre <- predict(diabetes_MLP2_WD4,x_train,type="prob") pre <- predict(diabetes_MLP2_WD4,x_valid,type="prob")”

ImportError Traceback (most recent call last) <ipython-input-3-b25a42d5a266> in <module>() 8 from sklearn.preprocessing import StandardScaler,PowerTransformer 9 from sklearn.linear_model import LinearRegression,LassoCV,LogisticRegression ---> 10 from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier,RandomForestRegressor 11 from sklearn.model_selection import KFold,train_test_split,StratifiedKFold,GridSearchCV,cross_val_score 12 from sklearn.metrics import mean_squared_error, mean_absolute_error, r2_score,accuracy_score, precision_score,recall_score, roc_auc_score ~\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\ensemble\__init__.py in <module>() 3 classification, regression and anomaly detection. 4 """ ----> 5 from ._base import BaseEnsemble 6 from ._forest import RandomForestClassifier 7 from ._forest import RandomForestRegressor ~\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\ensemble\_base.py in <module>() 16 from ..base import BaseEstimator 17 from ..base import MetaEstimatorMixin ---> 18 from ..tree import DecisionTreeRegressor, ExtraTreeRegressor 19 from ..utils import Bunch, _print_elapsed_time 20 from ..utils import check_random_state ~\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\tree\__init__.py in <module>() 4 """ 5 ----> 6 from ._classes import BaseDecisionTree 7 from ._classes import DecisionTreeClassifier 8 from ._classes import DecisionTreeRegressor ~\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\tree\_classes.py in <module>() 39 from ..utils.validation import check_is_fitted 40 ---> 41 from ._criterion import Criterion 42 from ._splitter import Splitter 43 from ._tree import DepthFirstTreeBuilder sklearn\tree\_criterion.pyx in init sklearn.tree._criterion() ImportError: DLL load failed: 找不到指定的模块。 怎么改

#预测因子(海温) #nino3.4赤道东太平洋(190-220,-5-5) a22=sst_djf.sel(lon=slice(190,220),lat=slice(5,-5)).mean(axis=1).mean(axis=1) a2=(a22-a22.mean())/a22.std() #赤道印度洋(50-80,-5-5) a33=sst_djf.sel(lon=slice(50,100),lat=slice(5,-5)).mean(axis=1).mean(axis=1) a3=(a33-a33.mean())/a33.std() #预测因子(环流场) #南欧(30-40,35-45) b11=hgt_djf.sel(lon=slice(30,40),lat=slice(45,35)).mean(axis=1).mean(axis=1) b1=(b11-b11.mean())/b11.std() #太平洋副高(120-180,-10-10) b22=hgt_djf.sel(lon=slice(120,180),lat=slice(10,-10)).mean(axis=1).mean(axis=1) b2=(b22-b22.mean())/b22.std() #印度洋(60-80,-10-10) b33=hgt_djf.sel(lon=slice(60,80),lat=slice(10,-10)).mean(axis=1).mean(axis=1) b3=(b33-b33.mean())/b33.std() x=np.vstack([(a2,a3,b1,b2,b3)]).T x2=np.vstack([(a2,b1)]).T y=pre_standard #多元线性回归 res=np.linalg.lstsq(x,y,rcond=None) n=res[0] ##各项系数 y_fit=(n.T*x).sum(axis=1) #拟合数据 res2=np.linalg.lstsq(x2,y,rcond=None) n2=res2[0] ##各项系数 y_fit2=(n2.T*x2).sum(axis=1) #拟合数据 #可视化 time=np.arange(1961,2017,1) fig = plt.figure(figsize=[16, 5]) ax = fig.add_subplot() ax.plot(time, y,marker='o', color='gray', markersize=5) ax.plot(time, y_fit,marker='*', color='b', markersize=5) ax.plot(time, y_fit2,marker='^', color='r', markersize=5) ax.set_title('model',fontsize=20,fontweight='bold') ax.set_xlabel('Time') ax.set_ylabel('Pre') plt.legend(['Source data','Fitted1','Fitted2'],frameon=False,loc='best') plt.show()选做剔除一年的交叉检验,独立试报

介绍一下这段代码的Depthwise卷积层def get_data4EEGNet(kernels, chans, samples): K.set_image_data_format('channels_last') data_path = '/Users/Administrator/Desktop/project 5-5-1/' raw_fname = data_path + 'concatenated.fif' event_fname = data_path + 'concatenated.fif' tmin, tmax = -0.5, 0.5 #event_id = dict(aud_l=769, aud_r=770, foot=771, tongue=772) raw = io.Raw(raw_fname, preload=True, verbose=False) raw.filter(2, None, method='iir') events, event_id = mne.events_from_annotations(raw, event_id={'769': 1, '770': 2,'770': 3, '771': 4}) #raw.info['bads'] = ['MEG 2443'] picks = mne.pick_types(raw.info, meg=False, eeg=True, stim=False, eog=False) epochs = mne.Epochs(raw, events, event_id, tmin, tmax, proj=False, picks=picks, baseline=None, preload=True, verbose=False) labels = epochs.events[:, -1] print(len(labels)) print(len(epochs)) #epochs.plot(block=True) X = epochs.get_data() * 250 y = labels X_train = X[0:144,] Y_train = y[0:144] X_validate = X[144:216, ] Y_validate = y[144:216] X_test = X[216:, ] Y_test = y[216:] Y_train = np_utils.to_categorical(Y_train - 1) Y_validate = np_utils.to_categorical(Y_validate - 1) Y_test = np_utils.to_categorical(Y_test - 1) X_train = X_train.reshape(X_train.shape[0], chans, samples, kernels) X_validate = X_validate.reshape(X_validate.shape[0], chans, samples, kernels) X_test = X_test.reshape(X_test.shape[0], chans, samples, kernels) return X_train, X_validate, X_test, Y_train, Y_validate, Y_test kernels, chans, samples = 1, 3, 251 X_train, X_validate, X_test, Y_train, Y_validate, Y_test = get_data4EEGNet(kernels, chans, samples) model = EEGNet(nb_classes=3, Chans=chans, Samples=samples, dropoutRate=0.5, kernLength=32, F1=8, D=2, F2=16, dropoutType='Dropout') model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy']) checkpointer = ModelCheckpoint(filepath='/Users/XXX/baseline.h5', verbose=1, save_best_only=True) class_weights = {0: 1, 1: 1, 2: 1, 3: 1} fittedModel = model.fit(X_train, Y_train, batch_size=2, epochs=100, verbose=2, validation_data=(X_validate, Y_validate), callbacks=[checkpointer], class_weight=class_weights) probs = model.predict(X_test) preds = probs.argmax(axis=-1) acc = np.mean(preds == Y_test.argmax(axis=-1)) print("Classification accuracy: %f " % (acc))

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