tcgagene<-separate(tcgagene,sample,into= c("Ensembl_ID"),sep="\\.")#去除Ensembl_ID小数点后面的数字 Error in `separate()`: ! Can't extract column with `!!enquo(col)`. ✖ `!!enquo(col)` must be numeric or character, not a function. Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.
时间: 2024-02-15 15:02:19 浏览: 151
这个错误可能是因为在使用`separate()`函数时,传入的参数`col`不是字符或数字类型。可以尝试使用`quo_name()`将参数转化为字符类型,如下所示:
```
tcgagene <- separate(tcgagene, !!quo_name(sample), into = c("Ensembl_ID"), sep = "\\.")
```
这样应该可以解决这个问题。
相关问题
> merged_df <- merge(df_with_names, gene_data, by.x = ..., by.y = "ensembl_gene_id") # 通过基因ID字段合并 错误: '...'用在的上下文不对 解读该代码,并告诉我该如何修改正确
这个`R`语言的代码片段试图使用`merge()`函数将`df_with_names`数据框和`gene_data`数据框按照基因ID字段进行合并。在这里,`...`通常用于占位符,表示你应该提供具体的列名或索引来指定`by.x`,即在`df_with_names`中用于合并的关键列。
`by.x`参数指定了`df_with_names`中的列名,而`by.y`参数则指定了`gene_data`中的列名,这里是"ensembl_gene_id"。
由于`...`被误用并且显示了“用在的上下文不对”,你需要明确指定在`df_with_names`中作为合并键的列名。假设在`df_with_names`中有一个名为`gene_id_column`的列对应于`gene_data`的`ensembl_gene_id`,你可以这样修改:
```R
merged_df <- merge(df_with_names, gene_data, by.x = "gene_id_column", by.y = "ensembl_gene_id")
```
确保`gene_id_column`是你想要合并的列,并且这两个表中的基因ID匹配。
**相关问题--:**
1. `merge()`函数默认采用哪种合并策略(内联、外联等)?
2. 如何避免在`merge()`中出现缺失值(NA)的问题?
3. 如果`gene_id_column`不存在,应该如何修改代码?
"-separate(lihcdata,ensembl_id,into = c(\"ensembl_id\"),sep=\"\\\\.\")"
这段代码是在R语言中使用的,目的是将lihcdata中的ensembl_id按照"."进行分割,并且将分割后的结果存储在一个名为"ensembl_id"的变量中。
具体来说,该代码使用了separate函数,该函数来自tidyverse包。第一个参数lihcdata是要分割的数据集,第二个参数ensembl_id是要被分割的列名,第三个参数into表示将分割后的结果存储在一个新的变量中,这里命名为"ensembl_id",最后一个参数sep表示分割的方式,由于R语言中的转义字符,所以需要使用双斜杠"\\\\"来表示一次转义。
举个例子来说,如果lihcdata中的ensembl_id列数据为"ENSG00000123456.1",那么经过这段代码处理后,会得到一个新的变量"ensembl_id",其值为c("ENSG00000123456", "1"),即将原本的"ENSG00000123456.1"分割成了两部分,以数组的形式存储。
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