thresh[mask == 1] = 0 IndexError: too many indices for array: array is 2-dimensional, but 3 were indexed

这个错误通常是由于使用了错误的索引方式引起的。`mask`和`thresh`都是二维数组，因此你只需要使用两个索引来访问它们的元素。在`thresh[mask == 1] = 0`行中，你使用了三个索引，因此引发了这个错误。

要解决这个问题，你只需要使用两个索引来访问`thresh`数组的元素。你可以使用`numpy`的`logical_not()`函数来创建一个与`mask`相反的掩码，然后将其传递给`thresh`数组，以将其内部的元素设置为0。

以下是一个更新后的代码示例：

import cv2
import numpy as np

# 读取单通道二值图像
img = cv2.imread('binary.png', cv2.IMREAD_GRAYSCALE)

# 检测圆形轮廓
circles = cv2.HoughCircles(img, cv2.HOUGH_GRADIENT, 1, 20, param1=50, param2=30, minRadius=0, maxRadius=0)

# 填充圆形区域
mask = np.zeros_like(img)
for circle in circles[0]:
    circle = np.int32(circle)
    pts = cv2.ellipse2Poly((circle[0], circle[1]), (circle[2], circle[2]), 0, 0, 360, 10)
    cv2.fillPoly(mask, [pts], 1)

# 将圆形区域内的像素值赋为0
thresh = cv2.threshold(img, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY)[1]
thresh[np.logical_not(mask)] = 0

# 保存处理后的图像
cv2.imwrite('result.png', thresh)

在这个代码中，我们使用`numpy`的`logical_not()`函数创建了一个与`mask`相反的掩码，然后使用它来更新`thresh`数组的元素。这样，`thresh`数组中的所有不在圆形区域内的元素都将被设置为0。

希望这可以解决你的问题！