r语言fiSome genes are constant. Hint: consider removing constant columns from datExpr.
时间: 2023-06-17 10:07:11 浏览: 64
在R语言中,可以使用以下代码来从数据框中删除常量列:
```r
datExpr <- datExpr[, which(!apply(datExpr, 2, function(x) length(unique(x))) == 1)]
```
这个代码使用了apply函数来计算每一列唯一值的数量,如果唯一值的数量为1,则说明该列是常量列。在which函数中,我们选择了不是常量列的列来更新datExpr数据框,从而删除了常量列。
相关问题
r语言Some genes are constant. Hint: consider removing constant columns from datExpr.
在 R 语言中,如果你的基因表达矩阵中有一些基因的表达值始终不变,那么可以考虑从 `datExpr` 中删除这些常数列。
可以使用以下代码来删除常数列:
```R
datExpr <- datExpr[, which(sd(datExpr) != 0)] # 删除标准差为 0 的列
```
这将使用 `sd` 函数计算每个列的标准差,并删除标准差为 0 的列,这些列对应于始终具有相同表达值的基因。
解释:class Individual: def __init__(self, genes=None): if genes = None: genes = [i for i in range(city_num)] random.shuffle(genes) self.genes = genes self.fitness = self.evalute_fitness()
这段代码是一个 Python 类,名为 Individual,用于表示一个个体。它包含一个构造函数 __init__,其中,如果 genes 参数没有被指定,那么会将 genes 初始化为一个城市数量(city_num)长度的列表,其中包含 0 到 city_num-1 的整数,然后随机打乱这个列表。最后,将生成的 genes 列表赋给实例变量 self.genes,并调用 evalute_fitness 方法计算该个体的适应度(fitness)。