python多张dicom图像融合
时间: 2023-07-08 13:25:51 浏览: 202
在Python中实现多张DICOM图像融合可以使用PyDICOM和NumPy库。以下是一个简单的示例代码:
```python
import numpy as np
import pydicom
import os
# 读取DICOM图像并转换为灰度图像
def read_dicom(filename):
ds = pydicom.dcmread(filename)
img = ds.pixel_array.astype(float)
img -= np.min(img)
img /= np.max(img)
return img
# 对图像进行配准
def register_images(images):
# 这里使用简单的平移配准
# 实际应用中可能需要更复杂的配准方法
ref = images[0]
registered = [ref]
for i in range(1, len(images)):
img = images[i]
dx = int((ref.shape[1] - img.shape[1]) / 2)
dy = int((ref.shape[0] - img.shape[0]) / 2)
trans = np.float32([[1, 0, dx], [0, 1, dy]])
img = cv2.warpAffine(img, trans, ref.shape[::-1])
registered.append(img)
return registered
# 将图像融合
def fuse_images(images):
# 这里使用简单的平均值法
# 实际应用中可能需要更复杂的融合方法
fused = np.mean(images, axis=0)
return fused
# 保存融合后的图像为DICOM格式
def save_dicom(img, filename):
ds = pydicom.dcmread(filename)
ds.PixelData = img.tobytes()
ds.save_as(filename)
if __name__ == '__main__':
# 读取多张DICOM图像
filenames = ['image1.dcm', 'image2.dcm', 'image3.dcm']
images = [read_dicom(filename) for filename in filenames]
# 对图像进行配准
registered = register_images(images)
# 将图像融合
fused = fuse_images(registered)
# 保存融合后的图像为DICOM格式
save_dicom(fused, 'fused.dcm')
```
注意,上述代码中的配准和融合方法都比较简单,实际应用中可能需要更复杂的算法来处理DICOM图像。同时,为了确保图像的质量和元数据不受影响,需要根据具体应用场景选择合适的配准方法和融合方法,并且遵循DICOM标准进行处理。
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