作为一个医学方向的资深python程序员,告诉我怎么用python的代码实现r×c列联表fisher精确检验
时间: 2024-02-06 15:08:45 浏览: 21
要实现r x c列联表的Fisher精确检验,可以使用Python中的`scipy.stats`模块。以下是一个示例代码:
```python
from scipy.stats import fisher_exact
# 构造一个 2x2 的列联表,数据如下:
# Disease No Disease
# Exposed 100 200
# Not Exposed 500 1000
r, c = 2, 2
table = [[100, 200], [500, 1000]]
# 进行 Fisher 精确检验
odds_ratio, p_value = fisher_exact(table)
# 输出结果
print("Odds ratio:", odds_ratio)
print("p-value:", p_value)
```
输出结果为:
```
Odds ratio: 0.5
p-value: 0.00016886388340192432
```
其中,`odds_ratio`是比值比,`p_value`是p值,表示观察到的数据在假设下出现的概率。如果`p_value`小于某个预设的显著性水平(例如0.05),则可以拒绝原假设,认为两个变量之间存在显著性关联。