现有fit_1、fit_2、fit_3、fit_4,4个模型,有4个c_index。使用compareC包,时间是time,事件是MACE,my_data <- read.csv(file="D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv") 修改代码,对已经求出来所有的的C-INDEX进行两两之间互相检验,列出检验结果
时间: 2024-03-15 18:43:55 浏览: 97
已经训练好的多个模型,
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好的,你可以使用以下代码对这四个模型进行两两之间互相检验:
```R
library(survival)
library(compareC)
# 读入数据
my_data <- read.csv(file="D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv")
# 创建生存对象
surv_obj <- with(my_data, Surv(time, MACE))
# 模型拟合
fit_1 <- survfit(surv_obj ~ Age, data = my_data)
fit_2 <- survfit(surv_obj ~ Age + Sex, data = my_data)
fit_3 <- survfit(surv_obj ~ Age + Sex + BMI, data = my_data)
fit_4 <- survfit(surv_obj ~ Age + Sex + BMI + Diabetes, data = my_data)
# 计算C-index
c_index_1 <- cindex(surv_obj, fit_1)
c_index_2 <- cindex(surv_obj, fit_2)
c_index_3 <- cindex(surv_obj, fit_3)
c_index_4 <- cindex(surv_obj, fit_4)
# 对C-index进行两两之间互相检验
compareC(c_index_1, c_index_2)
compareC(c_index_1, c_index_3)
compareC(c_index_1, c_index_4)
compareC(c_index_2, c_index_3)
compareC(c_index_2, c_index_4)
compareC(c_index_3, c_index_4)
```
这段代码中,我假设你已经定义了四个模型:`fit_1`、`fit_2`、`fit_3`和`fit_4`,并且已经计算出了它们的C-index:`c_index_1`、`c_index_2`、`c_index_3`和`c_index_4`。然后使用`compareC`函数对这些C-index进行两两之间互相检验。
注意,这里使用的是`compareC`包,而不是`compareGroups`函数。`compareC`包是专门用于比较两个或多个生存分析模型的性能的包。
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