详细解释以下这段代码import numpy as np from kmodes.kmodes import KModes import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.metrics import silhouette_score distortions = [] for i in range(1, 50): kmodes = KModes(n_clusters=i, init='Huang', n_init=1) kmodes.fit(data) distortions.append(kmodes.cost_) plt.plot(range(1, 50), distortions, marker='o') plt.xlabel('Number of clusters') plt.ylabel('Distortion') plt.show() for i in range(2, 7): kmodes = KModes(n_clusters=i, init='Huang', n_init=10, random_state=0) kmodes.fit(data) silhouette_avg = silhouette_score(data, kmodes.labels_) print("K-Modes clustering silhouette score for {} clusters: {}".format(i, silhouette_avg)) kmodes = KModes(n_clusters=3, init='Huang', n_init=10, random_state=0) kmodes.fit(data) silhouette_avg = silhouette_score(data, kmodes.labels_) print("K-Modes clustering silhouette score for 3 clusters: {}".format(silhouette_avg))
时间: 2023-06-27 10:08:20 浏览: 70
这段代码主要是使用K-Modes算法对数据进行聚类分析,并通过绘制畸变度和轮廓系数评估聚类效果。
具体步骤如下:
1. 导入必要的库,包括numpy、kmodes、matplotlib.pyplot、sklearn.metrics等。
2. 定义一个空列表distortions,用来存储每个簇数下的畸变度。
3. 对于每个簇数i,使用KModes算法进行聚类,将该聚类结果的畸变度存储到distortions列表中。
4. 绘制畸变度随簇数变化的曲线图,以便确定最佳的簇数。
5. 对于簇数在2-6之间的情况,分别使用KModes算法进行聚类,并计算该聚类结果的轮廓系数。
6. 输出每个簇数下的轮廓系数,以便评估聚类效果。
7. 最后,使用簇数为3的KModes算法进行聚类,并计算该聚类结果的轮廓系数,以进一步评估聚类效果。
总的来说,这段代码使用了K-Modes算法对数据进行了聚类分析,并通过绘制畸变度和轮廓系数来评估聚类效果。
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import random import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.metrics import silhouette_score from sklearn.decomposition import PCA plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] dataset=pd.read_excel('C:\\Users\\86180\\Desktop\\第一次数学建模\\湘菜口感好物质.xlsx') dataset = dataset.drop(dataset.index[:1], inplace=False) dataset = dataset.drop(dataset.columns[:1], axis=1, inplace=False) #matrix=dataset.values matrix=np.array(dataset) matrix=matrix.T matrix_xiang=matrix[:27] # 将NaN值替换为0 matrix_xiang = np.nan_to_num(matrix_xiang) # 检测矩阵中是否还有NaN值 这个代码报错TypeError: ufunc 'isnan' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''应如何修改
根据您提供的代码,错误出在尝试检测矩阵中是否还有NaN值时。出现错误的原因可能是矩阵中的元素类型不符合`np.isnan()`函数的要求。
为了解决这个问题,您可以尝试使用`np.isnan()`函数之前,先将矩阵的元素类型转换为浮点类型(float),然后再进行检测。下面是修改后的代码:
```python
import random
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.metrics import silhouette_score
from sklearn.decomposition import PCA
plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']
dataset = pd.read_excel('C:\\Users\\86180\\Desktop\\第一次数学建模\\湘菜口感好物质.xlsx')
dataset = dataset.drop(dataset.index[:1], inplace=False)
dataset = dataset.drop(dataset.columns[:1], axis=1, inplace=False)
matrix = np.array(dataset)
matrix = matrix.T
matrix_xiang = matrix[:27]
# 将NaN值替换为0
matrix_xiang = np.nan_to_num(matrix_xiang.astype(float))
# 检测矩阵中是否还有NaN值
has_nan = np.isnan(matrix_xiang).any()
if has_nan:
print("矩阵中存在NaN值")
else:
print("矩阵中没有NaN值")
```
在上述代码中,我使用`astype(float)`将矩阵的元素类型转换为浮点类型。然后,再对`matrix_xiang`进行NaN值的替换和检测。这样应该能够解决您遇到的问题。
from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.metrics import silhouette_score import numpy as np import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt # 读取数据 data = np.loadtxt(r"D:\数学建模\重航数学建模校赛\附件1(前50行).csv", encoding='gbk') # 定义肘部法函数 def find_best_k(data): SSE = [] for k in range(1, 11): estimator = KMeans(n_clusters=k) estimator.fit(data) SSE.append(estimator.inertia_) X = range(1, 11) plt.xlabel('k') plt.ylabel('SSE') plt.plot(X, SSE, 'o-') plt.show() # 计算轮廓系数 def calculate_silhouette_score(data, k): estimator = KMeans(n_clusters=k) estimator.fit(data) score = silhouette_score(data, estimator.labels_) return score # 调用函数 find_best_k(data) score = calculate_silhouette_score(data, 3) print(score)代码改进
以下是对代码的一些改进建议:
1. 在函数 `find_best_k` 中,绘制图表的代码应该放在 for 循环外面,否则每次循环都会绘制一次图表,影响代码效率。同时,应该添加一个变量记录最佳的 k 值,以便后续计算轮廓系数时使用。
2. 在计算轮廓系数时,不应该固定 k 值为 3,而应该使用最佳的 k 值。
3. 在绘制图表时,应该添加标题和图例,方便阅读。
综上所述,改进后的代码如下所示:
```python
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.metrics import silhouette_score
import numpy as np
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取数据
data = np.loadtxt(r"D:\数学建模\重航数学建模校赛\附件1(前50行).csv", encoding='gbk')
# 定义肘部法函数
def find_best_k(data):
SSE = []
for k in range(1, 11):
estimator = KMeans(n_clusters=k)
estimator.fit(data)
SSE.append(estimator.inertia_)
# 绘制肘部法图表
plt.plot(range(1, 11), SSE, 'o-')
plt.xlabel('k')
plt.ylabel('SSE')
plt.title('Elbow method')
plt.legend(['SSE'])
plt.show()
# 计算最佳 k 值
best_k = np.argmin(np.diff(SSE)) + 2
return best_k
# 计算轮廓系数
def calculate_silhouette_score(data, k):
estimator = KMeans(n_clusters=k)
estimator.fit(data)
score = silhouette_score(data, estimator.labels_)
return score
# 调用函数
best_k = find_best_k(data)
score = calculate_silhouette_score(data, best_k)
print("Best k value:", best_k)
print("Silhouette score:", score)
```
改进后的代码中,肘部法图表只绘制了一次,最佳 k 值也只计算了一次,同时添加了标题和图例,方便阅读。轮廓系数计算时使用了最佳的 k 值,保证了计算结果的准确性。