详细解释以下这段代码import numpy as np from kmodes.kmodes import KModes import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.metrics import silhouette_score distortions = [] for i in range(1, 50): kmodes = KModes(n_clusters=i, init='Huang', n_init=1) kmodes.fit(data) distortions.append(kmodes.cost_) plt.plot(range(1, 50), distortions, marker='o') plt.xlabel('Number of clusters') plt.ylabel('Distortion') plt.show() for i in range(2, 7): kmodes = KModes(n_clusters=i, init='Huang', n_init=10, random_state=0) kmodes.fit(data) silhouette_avg = silhouette_score(data, kmodes.labels_) print("K-Modes clustering silhouette score for {} clusters: {}".format(i, silhouette_avg)) kmodes = KModes(n_clusters=3, init='Huang', n_init=10, random_state=0) kmodes.fit(data) silhouette_avg = silhouette_score(data, kmodes.labels_) print("K-Modes clustering silhouette score for 3 clusters: {}".format(silhouette_avg))
时间: 2023-06-27 19:08:20 浏览: 233
这段代码主要是使用K-Modes算法对数据进行聚类分析,并通过绘制畸变度和轮廓系数评估聚类效果。
具体步骤如下:
1. 导入必要的库,包括numpy、kmodes、matplotlib.pyplot、sklearn.metrics等。
2. 定义一个空列表distortions,用来存储每个簇数下的畸变度。
3. 对于每个簇数i,使用KModes算法进行聚类,将该聚类结果的畸变度存储到distortions列表中。
4. 绘制畸变度随簇数变化的曲线图,以便确定最佳的簇数。
5. 对于簇数在2-6之间的情况,分别使用KModes算法进行聚类,并计算该聚类结果的轮廓系数。
6. 输出每个簇数下的轮廓系数,以便评估聚类效果。
7. 最后,使用簇数为3的KModes算法进行聚类,并计算该聚类结果的轮廓系数,以进一步评估聚类效果。
总的来说,这段代码使用了K-Modes算法对数据进行了聚类分析,并通过绘制畸变度和轮廓系数来评估聚类效果。
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import random import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.metrics import silhouette_score from sklearn.decomposition import PCA plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] dataset=pd.read_excel('C:\\Users\\86180\\Desktop\\第一次数学建模\\湘菜口感好物质.xlsx') dataset = dataset.drop(dataset.index[:1], inplace=False) dataset = dataset.drop(dataset.columns[:1], axis=1, inplace=False) #matrix=dataset.values matrix=np.array(dataset) matrix=matrix.T matrix_xiang=matrix[:27] # 将NaN值替换为0 matrix_xiang = np.nan_to_num(matrix_xiang) # 检测矩阵中是否还有NaN值 这个代码报错TypeError: ufunc 'isnan' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''应如何修改
根据您提供的代码,错误出在尝试检测矩阵中是否还有NaN值时。出现错误的原因可能是矩阵中的元素类型不符合`np.isnan()`函数的要求。
为了解决这个问题,您可以尝试使用`np.isnan()`函数之前,先将矩阵的元素类型转换为浮点类型(float),然后再进行检测。下面是修改后的代码:
```python
import random
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.metrics import silhouette_score
from sklearn.decomposition import PCA
plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']
dataset = pd.read_excel('C:\\Users\\86180\\Desktop\\第一次数学建模\\湘菜口感好物质.xlsx')
dataset = dataset.drop(dataset.index[:1], inplace=False)
dataset = dataset.drop(dataset.columns[:1], axis=1, inplace=False)
matrix = np.array(dataset)
matrix = matrix.T
matrix_xiang = matrix[:27]
# 将NaN值替换为0
matrix_xiang = np.nan_to_num(matrix_xiang.astype(float))
# 检测矩阵中是否还有NaN值
has_nan = np.isnan(matrix_xiang).any()
if has_nan:
print("矩阵中存在NaN值")
else:
print("矩阵中没有NaN值")
```
在上述代码中,我使用`astype(float)`将矩阵的元素类型转换为浮点类型。然后,再对`matrix_xiang`进行NaN值的替换和检测。这样应该能够解决您遇到的问题。
import numpy as np from sklearn.cluster import KMeans import collections from sklearn import metrics import matplotlib.pyplot as plt plt.rcParams['font.family'] = 'SimHei' # 正常显示中文 # 参数寻优 inertia = [] silhouettteScore = [] # 计算聚类数目为2至9时的轮廓系数值和簇内误差平方和 for i in range(2, 10): km = KMeans(n_clusters=i, random_state=12).fit(ScoreModel) y_pred = km.predict(ScoreModel) center_ = km.cluster_centers_ score = metrics.silhouette_score(ScoreModel, km.labels_) silhouettteScore.append([i, score]) inertia.append([i, km.inertia_]) # 绘制轮廓系数图 silhouettteScore = np.array(silhouettteScore) plt.plot(silhouettteScore[: , 0], silhouettteScore[: , 1]) plt.title('轮廓系数值 - 聚类数目') plt.show() #绘制簇内误差平方和图 inertia = np.array(inertia) plt.plot(inertia[: , 0], inertia[: , 1]) plt.title('簇内误差平方和 - 聚类数目') plt.show()
这段代码使用了 Python 中的 sklearn 库中的 KMeans 算法,对 ScoreModel 进行聚类分析,并绘制了聚类数目与轮廓系数值、簇内误差平方和之间的关系图。
首先设置了中文字体,以便在图表中正常显示中文。然后定义了空列表 inertia 和 silhouettteScore,用于保存不同聚类数目下的簇内误差平方和和轮廓系数值。
接着使用 for 循环,将聚类数目从 2 到 9,每次分别对 ScoreModel 进行 KMeans 聚类,并计算轮廓系数值和簇内误差平方和。其中,轮廓系数值用于度量聚类结果的质量,簇内误差平方和用于评估聚类的紧密度和密度。
最后,使用 matplotlib 库绘制了轮廓系数值与聚类数目、簇内误差平方和与聚类数目之间的关系图,并调用 plt.show() 函数显示图表。
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