对于有pandas.DataFrame的函数,应该如何使用c/c++加速
时间: 2023-05-28 11:03:35 浏览: 449
可以使用Cython或Numba将Python代码编译成C或JIT编译的机器码来加速Pandas.DataFrame函数。以下是使用Cython加速Pandas.DataFrame函数的一些步骤:
1. 安装Cython:使用pip install cython安装Cython。
2. 编写Cython代码:将Pandas.DataFrame函数转化为Cython代码,添加类型定义和C语言语法。
3. 编译Cython代码:使用cythonize命令将Cython代码编译成C代码。
4. 构建Python扩展:使用setup.py文件构建Python扩展,将C代码编译成共享库。
5. 使用Python扩展:在Python代码中导入编译好的Python扩展,并使用加速的Pandas.DataFrame函数。
以下是一个使用Cython加速Pandas.DataFrame的示例代码:
```
import pandas as pd
import numpy as np
import cython
# 定义Cython函数
@cython.boundscheck(False)
@cython.wraparound(False)
@cython.cdivision(True)
cpdef pd.DataFrame my_func(pd.DataFrame df):
cdef int n_rows = df.shape[0]
cdef int n_cols = df.shape[1]
cdef np.ndarray[np.float64_t, ndim=2] arr = df.values
cdef np.ndarray[np.float64_t, ndim=1] col_sums = np.zeros(n_cols, dtype=np.float64)
cdef int i, j
# 计算列总和
for i in range(n_rows):
for j in range(n_cols):
col_sums[j] += arr[i,j]
# 创建新的DataFrame
new_df = pd.DataFrame(columns=df.columns)
new_df.loc[0] = col_sums
return new_df
# 编译Cython代码
from Cython.Build import cythonize
cythonize("my_func.pyx")
# 构建Python扩展
from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize
setup(ext_modules=cythonize("my_func.pyx"))
# 使用Python扩展
import my_func
df = pd.DataFrame(np.random.rand(100, 100))
new_df = my_func.my_func(df)
```
使用Numba加速Pandas.DataFrame函数的步骤与上面类似,只需要将Cython替换为Numba即可。
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