Error in cph(Surv(time, Y) ~ ., X = T, y = T, data = surv, surv = T, n = 17836) : argument 6 matches multiple formal arguments

这个错误提示是因为在 cph() 函数中，参数 "surv" 和 "n" 都被匹配到了第六个参数位置。这可能是因为你的代码中使用了过时的参数名或者参数位置不正确。

你可以尝试在函数中指定参数名来避免这个问题，比如将 "surv" 参数指定为 "id"，将 "n" 参数指定为 "maxiter"，如下所示：

cph(Surv(time, Y) ~ ., X = T, y = T, data = surv, id = T, maxiter = 17836)

这样就可以避免参数位置混淆的问题。另外，你也可以查看一下 cph() 函数的帮助文档，确保你使用的是正确的参数名和参数位置。

相关问题

fcox3 <- cph(Surv(OS.time, OS) ~ RiskGroup + pstage +gender, surv=T,x=T, y=T, time.inc = 36, data=my.cli.3) cal3 <- calibrate(fcox3, cmethod="KM", method="boot", u=36, m=94, B=500)#m，是根据样本量n而定，一般m=n/4或n/5即可 fcox5 <- cph(Surv(OS.time, OS) ~ RiskGroup + pstage +gender, surv=T,x=T, y=T, time.inc = 60, data=my.cli.3) cal5 <- calibrate(fcox5, cmethod="KM", method="boot", u=60, m=94, B=500)# 怎么把cal3,cal5 画在一幅图上

您可以使用 `plot()` 函数将 `cal3` 和 `cal5` 的结果画在同一幅图上，具体步骤如下：

1. 首先，使用 `plot()` 函数绘制 `cal3` 的校准曲线，设置 `xlim` 和 `ylim` 参数来确定 x 轴和 y 轴的取值范围，同时设置 `col` 参数来指定曲线的颜色，例如：

   plot(cal3, xlim=c(0, 1), ylim=c(0, 1), col="blue")

2. 接着，使用 `lines()` 函数将 `cal5` 的校准曲线添加到图中，同样设置 `col` 参数来指定曲线的颜色，例如：

   lines(cal5, col="red")

3. 最后，添加图例，可以使用 `legend()` 函数来添加图例，指定 `legend` 参数为一个字符向量，其中包含两个元素，分别对应于 `cal3` 和 `cal5` 的标签，例如：

   legend("bottomright", legend=c("Time=36", "Time=60"), col=c("blue", "red"), lty=1)

其中，`"bottomright"` 参数指定图例的位置，`lty=1` 参数指定线条类型为实线。

综上所述，您可以使用如下的 R 代码来绘制 `cal3` 和 `cal5` 的校准曲线并添加图例：

plot(cal3, xlim=c(0, 1), ylim=c(0, 1), col="blue")
lines(cal5, col="red")
legend("bottomright", legend=c("Time=36", "Time=60"), col=c("blue", "red"), lty=1)

运行上述代码，即可得到 `cal3` 和 `cal5` 校准曲线的图像，并且图像中包含了图例，方便您对比两个曲线的区别。

coxm <- cph(Surv(T,E)~`original:firstorder:RobustMeanAbsoluteDeviation`+`log-sigma-4-0-mm-3D:firstorder:InterquartileRange`+`log-sigma-5-0-mm-3D:glszm:SmallAreaEmphasis`+`wavelet-HHL:firstorder:Mean`+`wavelet-HHH:firstorder:Mean`,x=T,y=T,data=df,surv=T) Error in as.data.frame.default(data, optional = TRUE) : cannot coerce class ‘"function"’ to a data.frame

这个错误是因为你在使用`cph`函数时传递了一个函数作为数据参数。`cph`函数期望接收一个数据框作为数据参数，而不是一个函数。

请确保你传递给`data`参数的是一个正确的数据框对象。你可以使用`str(df)`来检查你的数据框的结构和类别。如果你的数据不是一个数据框，请确保将其转换为数据框对象再传递给`cph`函数。