python实现:对给定的数据ColorHistogram.asc进行PCA主成分分析,并输出以下三个内容:PCA之前数据方差、PCA之后降至5维的数据、PCA之后数据方差。不调用pca库
时间: 2024-06-01 09:03:22 浏览: 136
这里提供一个基于numpy实现的PCA主成分分析代码:
```python
import numpy as np
# 读取数据
data = np.loadtxt('ColorHistogram.asc', dtype=np.float32)
# 数据中心化
mean = np.mean(data, axis=0)
centered_data = data - mean
# 计算协方差矩阵
cov_matrix = np.cov(centered_data, rowvar=False)
# 计算特征值和特征向量
eigenvalues, eigenvectors = np.linalg.eig(cov_matrix)
# 对特征向量按特征值大小排序
idx = eigenvalues.argsort()[::-1]
eigenvectors = eigenvectors[:, idx]
# 计算PCA之前数据方差
variance_before_pca = np.var(data, axis=0)
# 对数据进行降维
pca_data = np.dot(centered_data, eigenvectors[:, :5])
# 计算PCA之后数据方差
variance_after_pca = np.var(pca_data, axis=0)
# 输出结果
print('PCA之前数据方差:', variance_before_pca)
print('PCA之后降至5维的数据:', pca_data)
print('PCA之后数据方差:', variance_after_pca)
```
需要注意的是,这里使用了numpy中的函数进行协方差矩阵的计算和特征值分解。在实际应用中,为了提高代码效率和减少内存占用,可以使用一些专门进行矩阵计算的库,例如scipy和torch等。
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