DPC-KNN算法oython
时间: 2023-07-10 07:13:52 浏览: 326
用Python实现KNN算法
DPC-KNN是一种密度峰值聚类算法,可以用于数据聚类。下面是使用Python实现DPC-KNN算法的基本流程:
1. 首先读取数据并进行预处理,比如去除异常值、标准化数据等操作。
2. 然后计算每个数据点的密度值,并找到局部密度峰值点。这里可以使用KNN算法来计算密度值,具体实现可以使用scikit-learn库中的NearestNeighbors类来实现。
3. 对于每个局部密度峰值点,使用KNN算法找到其相邻点,并将它们划分到同一个簇中。这里可以使用scikit-learn库中的KMeans类来实现。
4. 最后对于未被划分的点,将它们分配到离它们最近的簇中。
下面是一个简单的Python实现:
```python
import numpy as np
from sklearn.neighbors import NearestNeighbors
from sklearn.cluster import KMeans
def dpcknn(X, k=5, eps=0.5, min_samples=5):
# 计算每个点的密度值
nbrs = NearestNeighbors(n_neighbors=k+1).fit(X)
distances, indices = nbrs.kneighbors(X)
density = 1.0 / (distances[:,1:].sum(axis=1) / k)
# 找到局部密度峰值点
center_indices = np.argsort(density)[::-1]
center_mask = np.zeros(len(X), dtype=bool)
center_mask[center_indices[:min_samples]] = True
for i in center_indices[min_samples:]:
if (center_mask[indices[i,1:]]).sum() > 1:
center_mask[i] = True
# 使用KMeans算法进行聚类
kmeans = KMeans(n_clusters=np.sum(center_mask)).fit(X[center_mask])
# 将未被划分的点分配到离它们最近的簇中
labels = -np.ones(len(X), dtype=int)
labels[center_mask] = kmeans.labels_
nbrs = NearestNeighbors(n_neighbors=1).fit(X[center_mask])
distances, indices = nbrs.kneighbors(X)
for i in range(len(X)):
if not center_mask[i]:
labels[i] = labels[indices[i,0]]
return labels
```
其中,参数k表示KNN算法中的邻居数,eps表示密度峰值点的阈值,min_samples表示局部密度峰值点的最小数量。在使用时,可以调整这些参数来获得更好的聚类效果。
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