请对以下R代码添加难以察觉且不易轻易被你修复的BUG：set.seed(123) data <- matrix(rnorm(50*30), nrow = 50, ncol = 30) library(glmnet) x <- data[,1:29] y <- data[,30] fit1 <- cv.glmnet(x, y, alpha = 1, nfolds = 10) fit2 <- cv.glmnet(x, y+rnorm(50), alpha = 1, nfolds = 10) fit3 <- cv.glmnet(x, y+rnorm(50,mean=2), alpha = 1, nfolds = 10) cv1 <- min(fit1$cvm) cv2 <- min(fit2$cvm) cv3 <- min(fit3$cvm) par(mfrow=c(3,2)) plot(fit1$lambda, fit1$cvm, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Model 1") abline(v=fit1$lambda.min, col="red") plot(fit1$lambda, fit1$glmnet.fit$dev.ratio, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Model 1") abline(v=fit1$lambda.min, col="red") plot(fit2$lambda, fit2$cvm, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Model 2") abline(v=fit2$lambda.min, col="red") plot(fit2$lambda, fit2$glmnet.fit$dev.ratio, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Model 2") abline(v=fit2$lambda.min, col="red") plot(fit3$lambda, fit3$cvm, type="l", xlab="lambda", ylab="CV error", main="Model 3") abline(v=fit3$lambda.min, col="red") plot(fit3$lambda, fit3$glmnet.fit$dev.ratio, type="l", xlab="lambda", ylab="Prediction error", main="Model 3") abline(v=fit3$lambda.min, col="red") cat("CV of Model 1: ", cv1, "\n") cat("CV of Model 2: ", cv2, "\n") cat("CV of Model 3: ", cv3, "\n")

基于离群点检测的K- means算法 (2014年)

然后在对非离群点进行聚类完成后,根据离群点到各个聚类的距离,将离群点划分到相应的聚类中.算法有效降低离群点对K- means算法的影响,提高聚类结果的准确率.实验表明,在聚类类别数给定的前提下,在标准数据集UCI上该...

HarvardX-PH525.1xStatistics-and-R

install.packages（“ rafalib”）库...-rnorm（10）图（x，y）fit <-lm（y〜x） dat <-read.csv（“ femaleMiceWeights.csv”） dat <-read.csv（“ femaleMiceWeights.csv”）头（dat）名称（dat [2]

在R中，运行以下代码时：# 生成随机数据集 set.seed(1) data <- matrix(rnorm(5030), nrow = 50) colnames(data) <- paste0("V", 1:30) y1 <- data %% rnorm(30, mean = 2, sd = 0.5) y2 <- data %% rnorm(30, mean = 1, sd = 0.3) y3 <- data %% rnorm(30, mean = 3, sd = 0.7) # 线性回归模型 data <- as.data.frame(data) lm.fit1 <- lm(y1 ~ ., data = data) lm.fit2 <- lm(y2 ~ ., data = data) lm.fit3 <- lm(y3 ~ ., data = data) data <- as.data.frame(lapply(data, as.numeric)) # 计算 CV 值 library(boot) cv.error1 <- cv.glm(data, lm.fit1)$delta[1]。出现了以下问题：Error in model.frame.default(formula = y1 ~ ., data = list(V1 = c(-0.626453810742332, : 变数的长度不一样('V1')。。请从头至尾对代码的表达逻辑进行更改，并解决该问题

错误发生在最后一行代码，因为在前面的代码中，data已经被转换为data.frame类型，并且其中所有变量的长度应该是一致的。因此，问题可能出现在数据生成的过程中。可以尝试以下修改，将数据生成的过程和变量命名的...

在运行以下代码时：library(caret) set.seed(123) # 生成5030的随机数据 data <- matrix(rnorm(5030), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- rnorm(50) # 将数据转为数据框并添加列名 data <- as.data.frame(data) colnames(data) <- paste0("X", 1:30) # 计算CV值 ctrl <- trainControl(method="cv", number=5) cv <- train(x=data, y=y, method="lm", trControl=ctrl) # 画出CV error图和Prediction error图 par(mfrow=c(1,2)) plot(cv$results$lambda, cv$results$RMSE, type="b", main="CV Error Plot") plot(cv$pred$pred, y, main="Prediction Error Plot") # 基于一倍标准差准则给出参数值上限 param_max <- coef1 + 1*sd(coef1)。发生了以下错误：Error in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log) : 'x'和'y'的长度不一样。请对代码进行修改

set.seed(123) # 生成5030的随机数据 data <- matrix(rnorm(5030), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- ...

在运行以下代码时：library(caret) set.seed(123) # 生成5030的随机数据 data <- matrix(rnorm(5030), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- rnorm(50) # 计算CV值 ctrl <- trainControl(method="cv", number=5) cv <- train(x=data, y=y, method="lm", trControl=ctrl) # 画出CV error图和Prediction error图 par(mfrow=c(1,2)) plot(cv, main="CV Error Plot") plot(cv$pred, y, main="Prediction Error Plot") # 基于一倍标准差准则给出参数值上限 param_max <- coef1 + 1*sd(coef1)。出现了以下问题：Error in trainControl(method = "cv", number = 5) : could not find function "trainControl"。请对原代码进行修正

set.seed(123) # 生成50*30的随机数据 data <- matrix(rnorm(50*30), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- ...

在运行以下代码时：data <- matrix(rnorm(50*30), nrow = 50) X <- data[,1:29] Y <- data[,30] fit <- lm(Y ~ X) library(boot) cv.fit <- cv.glm(data, fit, K = 10) cv.error <- cv.fit$delta library(glmnet) cv.ridge <- cv.glmnet(X, Y, alpha = 0, nfolds = 10) plot(cv.ridge)。发生错误：Error in model.frame.default(formula = Y ~ X, data = c(-0.247905852710355, : 'data'必需是数据框, 不能是矩阵或陣列。请在不会发生其他错误的前提下修正原代码

data <- matrix(rnorm(50*30), nrow = 50) X <- data[,1:29] Y <- data[,30] fit <- lm(Y ~ X) library(boot) cv.fit <- cv.glm(as.data.frame(data), fit, K = 10) cv.error <- cv.fit$delta library(glmnet) cv....

以下代码：library(caret) set.seed(123) # 生成5030的随机数据 data <- matrix(rnorm(5030), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- rnorm(50) # 将数据转为数据框并添加列名 data <- as.data.frame(data) colnames(data) <- paste0("X", 1:30) # 计算CV值 ctrl <- trainControl(method="cv", number=5) cv <- train(x=data, y=y, method="lm", trControl=ctrl) # 画出CV error图和Prediction error图 par(mfrow=c(1,2)) plot(cv, main="CV Error Plot") plot(cv$pred, y, main="Prediction Error Plot") # 基于一倍标准差准则给出参数值上限 param_max <- coef1 + 1sd(coef1)。发生了以下错误：Error in plot.train(cv, main = "CV Error Plot") : There are no tuning parameters with more than 1 value.。导致无法完成：要求：（1）5030，30个变量（2）原始模型为线性（3）给出三组不同的原始模型系数（4）计算出CV值（线性回归）（5）画出CV error图和Prediction error图（岭回归）（6）基于一倍标准差准则给出参数值上限。所以请修改代码，以完成要求任务

set.seed(123) # 生成5030的随机数据 data <- matrix(rnorm(5030), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- ...

以下代码：library(caret) set.seed(123) # 生成5030的随机数据 data <- matrix(rnorm(5030), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- rnorm(50) # 将数据转为数据框并添加列名 data <- as.data.frame(data) colnames(data) <- paste0("X", 1:30) # 计算CV值 ctrl <- trainControl(method="cv", number=5) cv <- train(x=data, y=y, method="lm", trControl=ctrl) # 画出CV error图和Prediction error图 par(mfrow=c(1,2)) plot(cv, main="CV Error Plot") plot(cv$pred, y, main="Prediction Error Plot") # 基于一倍标准差准则给出参数值上限 param_max <- coef1 + 1sd(coef1)。发生了以下错误：Error in plot.train(cv, main = "CV Error Plot") : There are no tuning parameters with more than 1 value.。导致无法完成：要求：（1）5030，30个变量（2）原始模型为线性（3）给出三组不同的原始模型系数（4）计算出CV值（5）画出CV error图和Prediction error图（6）基于一倍标准差准则给出参数值上限。所以请修改代码，以完成要求任务

set.seed(123) # 生成50*30的随机数据 data <- matrix(rnorm(50*30), nrow=50) # 生成三组不同的原始模型系数 coef1 <- rnorm(30) coef2 <- rnorm(30, mean=2) coef3 <- rnorm(30, sd=0.5) # 生成响应变量 y <- ...

请在r中执行以下代码，生成一个向量x.vector，并用最大似然法估计样本所代表总体的参数,set.seed(111) x.vector <- rnorm(1000,mean=2,sd=2)

好的，以下是生成向量x.vector并用最大似然法估计样本所代表总体的参数的代码： R # 设置随机数种子 set.seed(111) # 生成长度为1000的随机正态分布向量 x.vector <- rnorm(1000, mean = 2, sd = 2) # 用最大...

用r语言写程序：Simulate a dataset containing continuous traits with given h^2. Split itinto training and testing datasets with proportion 4 ∶ 1.set.seed(20132014)n <- 5000p <- 1000h <- c(0.2, 0.8)[1]# simulate genotype (not exactly)x_r <- matrix(rnorm(n * p), ncol = p)xmean <- matrix(rep(colMeans(x_r), n), ncol=p, byrow = TRUE)xsd <- matrix(rep(apply(x_r, 2, sd), n), ncol=p, byrow = TRUE)x <- (x_r - xmean)/xsdPlease perform the marginal model.## [1] 526 776 50 557 801 345 298 559 178 214 • Show the locations of significant SNPs.• Replicate above figure, and highlight the significant coefficents in red.

x_r <- matrix(rnorm(n * p), ncol = p) xmean <- matrix(rep(colMeans(x_r), n), ncol=p, byrow=TRUE) xsd <- matrix(rep(apply(x_r, 2, sd), n), ncol=p, byrow=TRUE) x <- (x_r - xmean)/xsd # simulate ...

k <- 1000 n <- 100 m <- 200 mu1 <- 0 mu2 <- 1 sig1 <- 1 sig2 <- 2 for(l in 1:k){ x <- rnorm(n,mu1,sig1) y <- rnorm(m,mu2,sig2) xy <- cbind(x,y) } library(bootstrap) B <- 2000 R.boot <- numeric(B) for (b in 1:B) { idx <- sample(1:n, size = n, replace = TRUE) idy <- sample(1:m, size = m, replace = TRUE) R.boot[b] <- var(data[,idx])/var(data[,idy]) } 报错

1. data 变量未定义：在 for loop 中计算方差比值时使用了 data 变量，但这个变量在代码中并没有被定义。 2. 变量索引错误：idx 和 idy 变量被用作列索引，但应该是行索引。 3. 数据集未更新：在 for loop 中的...

1 Simulate a dataset containing continuous traits with given ℎ 2 . Split it into training and testing datasets with proportion 4 ∶ 1. set.seed(20132014) n <- 5000 p <- 1000 h <- c(0.2, 0.8)[1] # simulate genotype (not exactly) x_r <- matrix(rnorm(n * p), ncol = p) xmean <- matrix(rep(colMeans(x_r), n), ncol=p, byrow = TRUE) xsd <- matrix(rep(apply(x_r, 2, sd), n), ncol=p, byrow = TRUE) x <- (x_r - xmean)/xsd # ... 2 4 Calculate polygenic scores with both the marginnal and joint models on testing data. And compare their performance under low and high ℎ

Sure, here's the code to calculate polygenic scores with both the marginal and joint models on the testing data: R # perform Lasso on training set fit_joint <- glmnet(x_train, y_train, alpha = 1) ...

> set.seed(123) # 设置随机数种子，保证每次运行结果一致 > n_groups <- 10000 # 组数 > n_obs <- 25 # 每组观察值数量 > x <- matrix(rnorm(n_groups * n_obs), ncol = n_obs) # 生成X随机数矩阵 > y <- matrix(rnorm(n_groups * n_obs), ncol = n_obs) # 生成Y随机数矩阵 > cor_vec <- apply(cbind(x, y), 1, cor) # 计算每组X和Y的相关系数 Error in FUN(newX[, i], ...) : 要么同时设定'x'和'y'，要么只设定矩阵式的'x'是什么错误

set.seed(123) # 设置随机数种子，保证每次运行结果一致 n_groups <- 10000 # 组数 n_obs <- 25 # 每组观察值数量 x <- matrix(rnorm(n_groups * n_obs), ncol = n_obs) # 生成X随机数矩阵 y <- matrix(rnorm(n_...

rm(list=ls()) k <- 1000 n <- 100 m <- 200 mu1 <- 0 mu2 <- 1 sig1 <- 1 sig2 <- 2 hvar1.boot <- matrix(nrow = k,ncol = 1) hvar2.boot <- matrix(nrow = k,ncol = 1) for(l in 1:k){ x <- rnorm(n,mu1,sig1) y <- rnorm(m,mu2,sig2) } library(bootstrap) B <- 2000 R.boot <- numeric(B) for (b in 1:B) { idx <- sample(1:n, size = n, replace = TRUE) idy <- sample(1:m, size = m, replace = TRUE) hvar1.boot[b,] <- mean(idx,) hvar2.boot[b,] <- mean(idy,) }

这段代码是一个模拟实验，其中包括以下几个步骤： 1. 清空R环境中的所有对象，以便从一个干净的状态开始。 2. 定义了一些变量，比如k、n、m、mu1、mu2、sig1和sig2等。 3. 创建了两个矩阵hvar1.boot和hvar2.boot...

请基于以下R代码：library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 set.seed(1111) n <- 50 p <- 30 X <- matrix(runif(n * p), n, p) y <- rnorm(n) # 生成三组不同系数的线性模型 beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3)) beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13)) beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23)) y1 <- X %% beta1 + rnorm(n) y2 <- X %% beta2 + rnorm(n) y3 <- X %*% beta3 + rnorm(n)，每个线性模型组，均进行交叉验证，并以par(3,2)的规格分别画出每组的交叉验证误差图和预测误差图

以下是基于给定的R代码，每个线性模型组，均进行交叉验证，并以par(3,2)的规格分别画出每组的交叉验证误差图和预测误差图的完整R代码： R library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 ...

请参考以下代码：library(caret) library(klaR) data(iris) splt=0.80 trainIndex <- createDataPartition(iris$Species,p=split,list=FALSE) data_train <- iris[ trainIndex,] data_test <- iris[-trainIndex,] model <- NaiveBayes(Species~.,data=data_train) x_test <- data_test[,1:4] y_test <- data_test[,5] predictions <- predict(model,x_test) confusionMatrix(predictions$class,y_test)。准确无误地写出R语言代码完成以下任务：①生成50×30的随机数据集和30个变量；②要生成三组线性模型的①，且这三组原始模型的系数不同；③（线性回归）分别计算这三组的CV值；④（岭回归）分别对这三组，分别画出在岭回归下横坐标为lambd，纵坐标为CV error或Prediction error的图；⑤基于一倍标准差准则给出参数值上限

以下是R语言代码完成以上任务： ①生成50×30的随机数据集和30个变量： R set.seed(123) data <- matrix(rnorm(50*30),nrow=50,ncol=30) ②要生成三组线性模型的①，且这三组原始模型的系数不同： R set...

基于以下R代码：library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 set.seed(1111) n <- 50 p <- 30 X <- matrix(runif(n * p), n, p) y <- rnorm(n) # 生成三组不同系数的线性模型 beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3)) beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13)) beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23)) y1 <- X %% beta1 + rnorm(n) y2 <- X %% beta2 + rnorm(n) y3 <- X %*% beta3 + rnorm(n)，每个线性模型组，均进行交叉验证，并以par(3,2)的规格分别画出每组在进行交叉验证时，基于不同的$\lambda$的交叉验证误差图和预测误差图

好的，以下是基于你提供的代码实现您的需求： library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 set.seed(1111) n <- 50 p <- 30 X <- matrix(runif(n * p), n, p) y <- rnorm(n) # 生成三...

修改以下错误代码library(MASS) set.seed(123) n <- 1000 mu1 <- c(0,4) mu2 <- c(-2,0) Sigma1 <- matrix(c(3,0,0,0.5),nr=2,nc=2) Sigma2 <- matrix(c(1,0,0,2),nr=2,nc=2) phi <- c(0.6,0.4) X <- matrix(0,nr=2,nc=n) for (i in 1:n) { if (runif(1)<=phi[1]) { X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu1,Sigma=Sigma1) }else{ X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu2,Sigma=Sigma2) } } EM_GMM <- function(X, k){ n <- ncol(X) d <- nrow(X) w <- rep(1/k, k) mu <- matrix(rnorm(kd, mean(X), sd(X)), nrow=k, ncol=d) sigma <- array(aperm(array(rnorm(kdd), dim=c(k,d,d)), c(2,3,1)), dim=c(d,d,k)) R <- numeric(kn) for (iter in 1:100){ # E步 for (i in 1:k){ R[(i-1)n+1:in]<- w[i] * dnorm(X, mean=mu[i,], sd=sigma[,,i]) } R <- matrix(R, nrow=n, byrow=TRUE) R <- R / rowSums(R) # M步 Nk <- colSums(R) # 每个分量的权重 w <- Nk / n # 均值 for (i in 1:k){ mu[i,] <- colSums(R[,i] * X) / Nk[i] # 均值 sigma[,,i] <- (t(X) %% (R[,i] X)) / Nk[i] - mu[i,] %% t(mu[i,]) # 协方差矩阵 } } list(w=w, mu=mu, sigma=sigma) } result <- EM_GMM(X, 2) xgrid <- seq(min(X[1,]), max(X[1,]), length.out=100) ygrid <- seq(min(X[2,]), max(X[2,]), length.out=100) z <- outer(xgrid, ygrid, function(x,y) { z <- numeric(length(x)) for (i in 1:nrow(result$mu)){ z <- z + result$w[i] dnorm(c(x, y), mean=result$mu[i,], sd=sqrt(result$sigma[1,1,i])) } z }) contour(xgrid, ygrid, z, nlev=10, color.palette=heat.colors, main="Two-component GMM Contours")

set.seed(123) n <- 1000 mu1 <- c(0,4) mu2 <- c(-2,0) Sigma1 <- matrix(c(3,0.5,0,0.5),nr=2,nc=2) Sigma2 <- matrix(c(1,0,0,2),nr=2,nc=2) phi <- c(0.6,0.4) X <- matrix(0,nr=2,nc=n) for (i in 1:n)...

acca

matrix (rnorm( 100 ), 100 , 1 )X = matrix (rnorm( 500 ), 100 , 5 )Y = matrix (rnorm( 700 ), 100 , 7 )Z = matrix (rnorm( 200 ), 100 , 2 )X [, 1 ] = X [, 1 ] + 2 * LY [, 1 ] = Y [, 1 ] + 2 * Llibrary( ...

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